STANDARD V14.4 • ROUTAGE O(1) Architecture relationnelle 24 pôles & 17 Index-Experts™ synchronisés avec la taxonomie NCBI 2026, EBI SIFTS 3D et cFMD/FMBN.
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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #1054962 • STRAIN • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #1054962
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Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 579083-10 "Bacillus cholerae-suis" Smith 1894

🌍 Salmonellosis foodborne pathogen ; Agent pathogène de la salmonellose

⚡ 2 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1))  •  🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)  •  🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Salmonella (genus)

🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)

Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages au lait cru à pâte molle ou pressée non cuite (Morbier, Saint-Nectaire, Reblochon, Cantal), fromages de chèvre
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

Symptômes et défauts de fabrication

🔎 Preuve SQLite
Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut Agent pathogène de la salmonellose • Aucune altération organoleptique détectable du fromage ; toxi-infection alimentaire collective sévère (critère réglementaire : absence dans 25 g)
Métabolites d'altération & filiation taxonomique Adaptation acide (réponse ATR) en cas de descente lente du pH en cuve permettant la survie tout au long de l'affinage
Substrats documentés & synonymes historiques Surveillance sanitaire des troupeaux et des filtres à lait, acidification lactique rapide et précoce en cuve, libération libératoire par PCR • Acidification insuffisante ou lente en cuve, survie prolongée à bas aw et dans la matière grasse fromagère, portage asymptomatique en élevage
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:1054962 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Collections de souches de référence DSM 17058, ATCC 13311 (Typhimurium), NCTC 12416, CIP 60.62
Sécurité opérateur & références PubMed PMID:29605355 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2018.03.011 🔎
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite
Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires Salmonellosis foodborne pathogen ; Agent pathogène de la salmonellose • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées Fromages au lait cru à pâte molle ou pressée non cuite (Morbier, Saint-Nectaire, Reblochon, Cantal), fromages de chèvre • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Salmonella (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) "Bacillus cholerae-suis" Smith 1894
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:1054962 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed PMID:29605355 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2018.03.011 🔎

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu
Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB PDB #10LI (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq RefSeq: GCA_000962315.1 • Taille: 4.83681 Mb • GC: 52.1 % • Statut: Contig • BioSample: SAMN01087999 • BioProject: PRJNA69863
Littérature primaire PubMed / DOI PMID:29605355 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2018.03.011 🔎