STANDARD V14.4 • ROUTAGE O(1) Architecture relationnelle 24 pôles & 17 Index-Experts™ synchronisés avec la taxonomie NCBI 2026, EBI SIFTS 3D et cFMD/FMBN.
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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #72000 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #72000
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Kocuria rhizophila Kocuria rhizophila Kovacs et al. 1999

🌍 Halotolerant bright-yellow rind spot and surface lipolysis actinobacterial agent ; Agent actinobactérien halotolérant des taches jaune vif de croûte et de lipolyse superficielle

⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1))  •  🧀 1 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Micrococcaceae (family) › Kocuria (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (1) :
🧀 Lactosérum

🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)

Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes pressées saumurées ou salées à sec (Gouda, Comté, Tomme, Manchego), pâtes molles et fromages de chèvre
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Synonymies et anciens noms (NCBI)

🔎 Preuve SQLite
Concordance de nomenclature (NCBI) Kocuria rhizophila (Kocuria rhizophila Kovacs et al. 1999)
Synonymes & basionymes historiques Halotolerant bright-yellow rind spot and surface lipolysis actinobacterial agent ; Agent actinobactérien halotolérant des taches jaune vif de croûte et de lipolyse superficielle • Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence Kocuria rhizophila Kovacs et al. 1999
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:72000 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Micrococcaceae (family) › Kocuria (genus)
Références taxonomiques PubMed PMID:18458160 🔎 • DOI:10.1128/JB.00078-08 🔎
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

Symptômes et défauts de fabrication

🔎 Preuve SQLite
Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut Agent actinobactérien halotolérant des taches jaune vif de croûte et de lipolyse superficielle • Ponctuations et taches circulaires jaune vif à jaune moutarde sur les croûtes blanches ou naturelles, accompagnées d'une légère odeur rance • Lactosérum [en:whey]
Métabolites d'altération & filiation taxonomique Biosynthèse membranaire de caroténoïdes C50 (sarcinaxanthine) et sécrétion d'estérases et de protéases actives en milieu salé
Substrats documentés & synonymes historiques Contrôle microbiologique du sel et filtration des saumures, nettoyage-désinfection des claies de ressuyage et maîtrise de la flore de surface • Halotolérance élevée (croissance jusqu'à 10-15 % NaCl), psychrotolérance (croissance dès 4-7 °C), aérobiose stricte, contamination par le sel ou les claies
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:72000 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Collections de souches de référence DSM 11926, ATCC 9341, NCTC 8340, CIP 53.45
Sécurité opérateur & références PubMed PMID:18458160 🔎 • DOI:10.1128/JB.00078-08 🔎
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite
Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) • Halotolerant bright-yellow rind spot and surface lipolysis actinobacterial agent ; Agent actinobactérien halotolérant des taches jaune vif de croûte et de lipolyse superficielle • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées Pâtes pressées saumurées ou salées à sec (Gouda, Comté, Tomme, Manchego), pâtes molles et fromages de chèvre • Lactosérum / Whey [en:whey] • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Micrococcaceae (family) › Kocuria (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) Lactosérum (EST 96.49 %, MNA 3.53 %, NaCl 2.46 g/100g) • Kocuria rhizophila Kovacs et al. 1999
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:72000 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed PMID:18458160 🔎 • DOI:10.1128/JB.00078-08 🔎

⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :

⚠️ Agent actinobactérien halotolérant des taches jaune vif de croûte et de lipolyse superficielle
DEFAUT_PIGMENTAIRE_TACHES🔎 Preuve
Ponctuations et taches circulaires jaune vif à jaune moutarde sur les croûtes blanches ou naturelles, accompagnées d'une légère odeur rance
Consulter la fiche clinique 360° →

🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (2) :
🦠 Kocuria rhizophila DC2201 #378753 🦠 Kocuria rhizophila P7-4 #1029824

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu
Assemblage Génomique NCBI RefSeq RefSeq: GCA_035990065.1 • Taille: 2.73569 Mb • GC: 70.6 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN29163636 • BioProject: PRJNA850115
Littérature primaire PubMed / DOI PMID:18458160 🔎 • DOI:10.1128/JB.00078-08 🔎
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:whey (n=2)