Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1002364 • STRAIN • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #1002364
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Hafnia alvei ATCC 51873 "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963
⚡ 5 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 9 linked cheese matrix/matrices • 🧊 3 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Hafniaceae (family)
› Hafnia (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (9) :
INDEX-EXPERT™ #00 • Tyrodexia™ Cheese Core
Palier 1
Master index of cheese starters and ripening cultures
🔎 SQLite Proof
| Associated dairy & cheese matrices | Camemberts [en:camemberts], Lactosérum [en:whey], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche [en:fresh-cheeses], Rocamadour [en:rocamadour], Livarot [en:livarot], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher] |
|---|---|
| Paste typology & technological evidence | Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) • Bacteria • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Secondary metabolites & reference collections | GCA_000239255.1 |
| Official sources & reference book | TaxID:1002364 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Matrix TDM % & FDM % | Taille: 4.88388 Mb • GC: 48.2 % • "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963 |
| Predatory bacteriophages & PubMed literature | Phages: Hafnia phage vB_HalM_SPARTY • PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Hafnia alvei ATCC 51873 ⟷ Hafnia alvei strain ATCC 51873 • Hafnia alvei str. ATCC 51873 |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963 |
| Official sources & reference book | TaxID:1002364 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #04 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 1
Cheese families and technologies
🔎 SQLite Proof
| Technological family & associated appellations | Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte molle à croûte lavée ; Fromages de chèvre ; Fromages à pâte molle à croûte naturelle • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] |
|---|---|
| Paste/rind diagram & technological function | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Official sources & reference book | TaxID:1002364 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Total dry matter (TDM %) & Fat in dry matter (FDM %) | Livarot (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Rocamadour (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) • Bacteria |
| Flagship cheeses (PDO / Caseus) & PubMed studies | Livarot (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Rocamadour (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Selles-sur-Cher (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Sainte-Maure de Touraine (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #05 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Technological markers (pH and gas)
🔎 SQLite Proof
| Carbohydrate substrates, residual lactose (USDA) & metabolites | Total lipid (fat) : 10.8 g ; Carbohydrate, by difference : 25 g ; Énergie : 229 kcal ; Eau : 54.7 g • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey] |
|---|---|
| Metabolic role & characterized compounds | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Draining, moisture, salting (USDA) & linked matrices | Livarot (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Rocamadour (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey] |
| Official sources & reference book | TaxID:1002364 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Vat phage monitoring & PubMed references | Phages: Hafnia phage vB_HalM_SPARTY (TaxID:2894718) • PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Livarot (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Rocamadour (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) • "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963 • Hafnia alvei strain ATCC 51873 • Hafnia alvei str. ATCC 51873 |
| Official sources & reference book | TaxID:1002364 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Hafnia alvei strain ATCC 51873 • Hafnia alvei str. ATCC 51873 |
|---|
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #9E0M (3 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_000239255.1 • Taille: 4.88388 Mb • GC: 48.2 % • Statut: Scaffold • BioSample: SAMN02299450 • BioProject: PRJNA65123 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |