Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1407017 • STRAIN • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #1407017
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Clostridium botulinum B str. Osaka05 "Bacillus botulinus" van Ermengem 1896
🌍 Botulism neurotoxigenic spore-forming foodborne pathogen ; Agent pathogène sporulé du botulisme alimentaire
⚡ 2 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 0 linked cheese matrix/matrices • 🧊 25 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Clostridia (class)
› Eubacteriales (order)
› Clostridiaceae (family)
› Clostridium (genus)
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages fondus, pâtes fraîches peu acides (Mascarpone), fromages conservés dans l'huile ou sous emballage anaérobie
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent pathogène sporulé du botulisme alimentaire • Parfois associé à un gonflement gazeux et une odeur butyrique/putride (souches protéolytiques du groupe I), ou sans altération marquée ; danger mortel de paralysie flasque par neurotoxines botuliques |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Germination des spores thermorésistantes et synthèse des neurotoxines botuliques (BoNT types A, B, E) clivant les protéines SNARE synaptiques |
| Documented substrates & historical synonyms | Maîtrise combinée du triptyque pH/aw/sels de fonte (polyphosphates, citrates, nisine), maintien absolu de la chaîne du froid (inférieure à 4 °C) et barèmes stérilisants validés • Anaérobiose stricte, pH supérieur à 4.6 (notamment Mascarpone à pH 5.8-6.2 ou fromages fondus), aw supérieur à 0.94, rupture de réfrigération (T° supérieure à 10-12 °C pour le groupe I ou dès 3.3 °C pour le groupe II) |
| Official sources & reference book | TaxID:1407017 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | ATCC 3502, NCTC 13319, CIP 104310 (Souche Hall) |
| Operator safety & PubMed references | PMID:9651303 🔎 • DOI:10.4315/0362-028X-61.6.738 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Botulism neurotoxigenic spore-forming foodborne pathogen ; Agent pathogène sporulé du botulisme alimentaire • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Fromages fondus, pâtes fraîches peu acides (Mascarpone), fromages conservés dans l'huile ou sous emballage anaérobie • Bacillota (phylum) › Clostridia (class) › Eubacteriales (order) › Clostridiaceae (family) › Clostridium (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | "Bacillus botulinus" van Ermengem 1896 |
| Official sources & reference book | TaxID:1407017 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:9651303 🔎 • DOI:10.4315/0362-028X-61.6.738 🔎 |
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #1E1H (25 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_000503815.1 • Taille: 4.40835 Mb • GC: 27.7 % • Statut: Scaffold • BioSample: SAMD00036773 • BioProject: PRJDB1500 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:9651303 🔎 • DOI:10.4315/0362-028X-61.6.738 🔎 |