Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #28151 • SPECIES • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #28151
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Serratia proteamaculans "Erwinia proteamaculans" (Paine and Stansfield 1919) Dye 1966
🌍 Psychrotrophic heat-resistant proteolysis, bitterness and rind liquefaction agent ; Agent psychrotrophe de protéolyse thermorésistante, d'amertume et de liquéfaction corticale
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 2 linked cheese matrix/matrices • 🧊 24 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Yersiniaceae (family)
› Serratia (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (2) :
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Laits réfrigérés de fromagerie, pâtes molles, pâtes pressées non cuites et pâtes filées (Mozzarella)
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Serratia proteamaculans ⟷ Erwinia proteamaculans • Pseudomonas proteamaculans • Xantomonas proteamaculans |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Psychrotrophic heat-resistant proteolysis, bitterness and rind liquefaction agent ; Agent psychrotrophe de protéolyse thermorésistante, d'amertume et de liquéfaction corticale • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Erwinia proteamaculans" (Paine and Stansfield 1919) Dye 1966 |
| Official sources & reference book | TaxID:28151 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Yersiniaceae (family) › Serratia (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent psychrotrophe de protéolyse thermorésistante, d'amertume et de liquéfaction corticale • Amertume intense, texture pâteuse ou coulante sous croûte, perte de rendement en cuve et odeur putride-soufrée • Bries [en:bries], Saint-nectaire [en:saint-nectaire] |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Sécrétion à basse température de la métalloprotéase dépendante du zinc serralysine (thermorésistante à la pasteurisation) et de lipases/décarboxylases |
| Documented substrates & historical synonyms | Limitation du temps de stockage du lait cru réfrigéré (inférieur à 48 h à moins de 4 °C), NEP des tanks de collecte et acidification rapide en cuve • Psychrotrophie marquée (croissance active dès 2-4 °C), garde prolongée du lait cru, pH supérieur à 5.3, contamination hydrique ou végétale |
| Official sources & reference book | TaxID:28151 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 4543, ATCC 19323, NCTC 11554, CIP 103237 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) • Psychrotrophic heat-resistant proteolysis, bitterness and rind liquefaction agent ; Agent psychrotrophe de protéolyse thermorésistante, d'amertume et de liquéfaction corticale • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Laits réfrigérés de fromagerie, pâtes molles, pâtes pressées non cuites et pâtes filées (Mozzarella) • Saint-nectaire [en:saint-nectaire], Bries [en:bries] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Yersiniaceae (family) › Serratia (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Saint-nectaire (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Bries (EST 51.6 %, MNA 66.94 %, NaCl 1.6 g/100g) • "Erwinia proteamaculans" (Paine and Stansfield 1919) Dye 1966 • Erwinia proteamaculans • Pseudomonas proteamaculans • Xantomonas proteamaculans |
| Official sources & reference book | TaxID:28151 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
⚠️ Cellar Clinical Vigilance & Generic Defects Monitoring (1)
Differential diagnosis of potential defects, biochemical mechanisms and cellar prophylaxis (Tier 3 — Practitioner):
⚠️ Psychrotrophic heat-resistant proteolysis, bitterness and rind liquefaction agent
ALTERATION_GUSTATIVE_AROME🔎 Proof
Amertume intense, texture pâteuse ou coulante sous croûte, perte de rendement en cuve et odeur putride-soufrée
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Erwinia proteamaculans • Pseudomonas proteamaculans • Xantomonas proteamaculans |
|---|
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #2VQX (24 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_949794035.1 • Taille: 5.5252 Mb • GC: 55.1439 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMEA114445085 • BioProject: PRJEB65351 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
📊 Quantitative Metagenomic Detections (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :