Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #3461408 • SUBSPECIES • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #3461408
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Enterobacter hoffmannii subsp. nototheniae "Enterobacter hoffmannii subsp. nototheniae" Sedlacek et al. 2025
🌍 Major E. cloacae-complex pressing-stage early gas-blowing defect agent ; Agent majeur du complexe E. cloacae responsable du gonflement précoce en sous-presse ; CDC Enteric Group 75
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 3 linked cheese matrix/matrices • 🧊 5 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Enterobacteriaceae (family)
› Enterobacter (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (3) :
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes molles, pâtes pressées non cuites et demi-cuites (Gouda, Tomme, Saint-Nectaire), fromages frais
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Enterobacter hoffmannii subsp. nototheniae ("Enterobacter hoffmannii subsp. nototheniae" Sedlacek et al. 2025) |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Major E. cloacae-complex pressing-stage early gas-blowing defect agent ; Agent majeur du complexe E. cloacae responsable du gonflement précoce en sous-presse ; CDC Enteric Group 75 • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Enterobacter hoffmannii subsp. nototheniae" Sedlacek et al. 2025 |
| Official sources & reference book | TaxID:3461408 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Enterobacter (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent majeur du complexe E. cloacae responsable du gonflement précoce en sous-presse • Ouvertures gazeuses en tête d'épingle sous croûte et à cœur, texture caoutchouteuse et exsudation anormale de lactosérum • Kéfir [en:kefir], Cheddars [en:cheddar-cheese], Fromages à pâte pressée cuite [en:hard-cheeses] |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Fermentation du lactose par la voie du 2,3-butanediol (production intense de CO2 et H2) et décarboxylation de l'ornithine en putrescine |
| Documented substrates & historical synonyms | Nettoyage-désinfection alcalin-chloré des moules, tables et stores d'égouttage, pasteurisation maîtrisée et activité optimale des ferments • Ralentissement de la cinétique d'acidification lactique, T° de salle de fabrication supérieure à 22 °C, résistance à la dessiccation et biofilms sur moules |
| Official sources & reference book | TaxID:3461408 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 16691, ATCC 49162, CIP 103441, CCUG 27126 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (6 éch.) • Major E. cloacae-complex pressing-stage early gas-blowing defect agent ; Agent majeur du complexe E. cloacae responsable du gonflement précoce en sous-presse ; CDC Enteric Group 75 • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Pâtes molles, pâtes pressées non cuites et demi-cuites (Gouda, Tomme, Saint-Nectaire), fromages frais • Kéfir / Kefir [en:kefir], Cheddars / Cheddar cheese [en:cheddar-cheese], Fromages à pâte pressée cuite / Hard cheeses [en:hard-cheeses] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Enterobacter (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Kéfir (EST 10.3 %, MNA 90.62 %, NaCl 0.1 g/100g) ; Cheddars (EST 63.2 %, MNA 55.17 %, NaCl 1.66 g/100g) ; Fromages à pâte pressée cuite (EST 70.0 %, MNA 40.0 %, NaCl 3.0 g/100g) • "Enterobacter hoffmannii subsp. nototheniae" Sedlacek et al. 2025 |
| Official sources & reference book | TaxID:3461408 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #7TO3 (5 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |