Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #526997 • STRAIN • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #526997
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Bacillus mycoides DSM 2048 Bacillus mycoides Flugge 1886 (Approved Lists 1980) emend. Liu et al. 2018
🌍 Sweet curdling and psychrotolerant vat destabilization agent ; Agent de la coagulation douce en cuve (caillage doux)
⚡ 2 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 0 linked cheese matrix/matrices • 🧊 1 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Caryophanales (order)
› Bacillaceae (family)
› Bacillus (genus)
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Laits de fromagerie stockés au froid, pâtes molles, pâtes pressées, caillés lactiques
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent de la coagulation douce en cuve (caillage doux) • Coagulation prématurée du lait sans acidification (coagulation douce), synérèse défectueuse, grain fragile, amertume précoce du caillé |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Sécrétion de métalloprotéases extracellulaires (type chymosine-like) hydrolysant la caséine kappa et de phospholipases C déstabilisant la membrane des globules gras |
| Documented substrates & historical synonyms | Limitation de la durée de garde du lait cru réfrigéré (< 36-48 h), propreté des fourrages et de la litière, microfiltration ou bactofugation • Stockage prolongé du lait réfrigéré (> 48 h à 4-7 °C), pH neutre à faiblement acide (6.0-6.7), spores thermorésistantes à la pasteurisation |
| Official sources & reference book | TaxID:526997 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 11821, ATCC 700462, CIP 105579, WSBC 10204 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:9603849 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-4-1373 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Sweet curdling and psychrotolerant vat destabilization agent ; Agent de la coagulation douce en cuve (caillage doux) • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Laits de fromagerie stockés au froid, pâtes molles, pâtes pressées, caillés lactiques • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Bacillaceae (family) › Bacillus (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Bacillus mycoides Flugge 1886 (Approved Lists 1980) emend. Liu et al. 2018 |
| Official sources & reference book | TaxID:526997 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:9603849 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-4-1373 🔎 |
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #3VOU (1 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_000003925.1 • Taille: 5.56191 Mb • GC: 35.2 % • Statut: Chromosome • BioSample: SAMN00727646 • BioProject: PRJNA29701 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:9603849 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-4-1373 🔎 |