Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #550 • SPECIES • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #550
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Enterobacter cloacae "Aerobacter cloacae" (Jordan 1890) Bergey et al. 1923
🌍 Pressing-stage coliform early blowing agent ; Agent coliforme du gonflement précoce en sous-presse
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 0 linked cheese matrix/matrices • 🧊 25 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Enterobacteriaceae (family)
› Enterobacter (genus)
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes molles au lait cru, pâtes pressées non cuites, fromages lactiques
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Enterobacter cloacae ⟷ Aerobacter cloacae • Bacillus cloacae • Bacterium cloacae • Cloaca cloacae |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Pressing-stage coliform early blowing agent ; Agent coliforme du gonflement précoce en sous-presse • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Aerobacter cloacae" (Jordan 1890) Bergey et al. 1923 |
| Official sources & reference book | TaxID:550 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Enterobacter (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:22575065 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2012.02.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent coliforme du gonflement précoce en sous-presse • Cavités gazeuses en tête d'épingle sous croûte ou à cœur, texture caoutchouteuse ou spongieuse, exsudation anormale de lactosérum |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Fermentation du lactose par la voie du 2,3-butanediol avec forte production de CO2 et d'H2 avant la chute du pH sous 5.2 |
| Documented substrates & historical synonyms | Nettoyage-désinfection rigoureux des moules, stores et tables d'égouttage, pasteurisation maîtrisée, levains lactiques vigoureux • Cinétique d'acidification ralentie (phages ou inhibiteurs), T° de salle de fabrication > 22 °C, biofilms sur moules |
| Official sources & reference book | TaxID:550 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 30054, ATCC 13047, NCTC 10005, CIP 60.85 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:22575065 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2012.02.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Pressing-stage coliform early blowing agent ; Agent coliforme du gonflement précoce en sous-presse • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Pâtes molles au lait cru, pâtes pressées non cuites, fromages lactiques • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Enterobacter (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | "Aerobacter cloacae" (Jordan 1890) Bergey et al. 1923 • Aerobacter cloacae • Bacillus cloacae • Bacterium cloacae • Cloaca cloacae |
| Official sources & reference book | TaxID:550 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:22575065 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2012.02.008 🔎 |
⚠️ Cellar Clinical Vigilance & Generic Defects Monitoring (1)
Differential diagnosis of potential defects, biochemical mechanisms and cellar prophylaxis (Tier 3 — Practitioner):
⚠️ Pressing-stage coliform early blowing agent
DEFAUT_PATE_GAZ_FENTES🔎 Proof
Cavités gazeuses en tête d'épingle sous croûte ou à cœur, texture caoutchouteuse ou spongieuse, exsudation anormale de lactosérum
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Aerobacter cloacae • Bacillus cloacae • Bacterium cloacae • Cloaca cloacae |
|---|
🔬 Subordinate strains and subspecies qualified in Tyrodexia™ (11) :
🦠 Enterobacter cloacae ECNIH2
#1333850
🦠 Enterobacter cloacae JD6301
#1399774
🦠 Enterobacter cloacae JD8715
#1399775
🦠 Enterobacter cloacae MR2
#1312879
🦠 Enterobacter cloacae S611
#1399146
🦠 Enterobacter cloacae subsp. cloacae
#336306
🦠 Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047
#716541
🦠 Enterobacter cloacae subsp. cloacae GS1
#1177927
🦠 Enterobacter cloacae subsp. dissolvens
#69219
🦠 Enterobacter cloacae subsp. dissolvens SDM
#1104326
🦠 Enterobacter cloacae subsp. rugosum
#1123957
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #1BLS (25 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_905331265.2 • Taille: 5.02344 Mb • GC: 54.8778 % • Statut: Complete Genome • BioProject: PRJNA251384 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:22575065 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2012.02.008 🔎 |