Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #77834 • NO RANK • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #77834
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Pantoea agglomerans pv. betae "Bacterium herbicola" Geilinger 1921
🌍 Plant-borne coliform early blowing and yellow cortical spot defect agent ; Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 0 linked cheese matrix/matrices • 🧊 9 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Erwiniaceae (family)
› Pantoea (genus)
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages au lait cru à pâte molle ou pressée non cuite (Saint-Nectaire, Tomme, Cantal, Reblochon), fromages de chèvre
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Pantoea agglomerans pv. betae ⟷ Erwinia herbicola pv. betae |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Plant-borne coliform early blowing and yellow cortical spot defect agent ; Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Bacterium herbicola" Geilinger 1921 |
| Official sources & reference book | TaxID:77834 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Erwiniaceae (family) › Pantoea (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales • Ouverture précoce irrégulière en petits trous, colonies ou taches jaunâtres sous la croûte et goût herbeux-amer |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Fermentation acide mixte des sucres du lait libérant CO2 et H2 et biosynthèse de caroténoïdes membranaires (zéaxanthine et ses glucosides) |
| Documented substrates & historical synonyms | Distribution des fourrages après la traite (réduction de l'empoussièrement), hygiène des trayons, refroidissement immédiat du lait et levains actifs • Contamination du lait par les poussières de foin, de paille ou de céréales lors de la traite, acidification initiale lente en cuve (pH supérieur à 5.4) |
| Official sources & reference book | TaxID:77834 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 3493, ATCC 27155, NCTC 9381, CIP 57.51 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Plant-borne coliform early blowing and yellow cortical spot defect agent ; Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Fromages au lait cru à pâte molle ou pressée non cuite (Saint-Nectaire, Tomme, Cantal, Reblochon), fromages de chèvre • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Erwiniaceae (family) › Pantoea (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | "Bacterium herbicola" Geilinger 1921 • Erwinia herbicola pv. betae |
| Official sources & reference book | TaxID:77834 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Erwinia herbicola pv. betae |
|---|
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #1C7G (9 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_001662025.2 • Taille: 5.0418 Mb • GC: 54.9366 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN04961652 • BioProject: PRJNA320975 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |