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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #991791 • STRAIN • Bacteria 🔎 NCBI Certificate #991791

Clostridium acetobutylicum DSM 1731 Clostridium acetobutylicum McCoy et al. 1926 (Approved Lists 1980)

🌍 Anaerobic spore-forming late butyric and solventogenic blowing defect agent ; Co-agent sporulé anaérobie du gonflement tardif butyrique et solvanté

⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 0 linked cheese matrix/matrices • 🧊 25 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices

Palier 2 • Fromager & Sommelier

Bacillota (phylum) › Clostridia (class) › Eubacteriales (order) › Clostridiaceae (family) › Clostridium (genus)

Palier 3 • Praticien & Affineur

Pâtes pressées cuites et demi-cuites (Grana Padano, Parmigiano Reggiano, Emmental, Comté, Gouda)

INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture Palier 5

🔎 SQLite Proof

Nomenclature concordance (NCBI)	Clostridium acetobutylicum DSM 1731 ⟷ Clostridium acetobutylicum ATCC 4259 • Clostridium acetobutylicum strain DSM 1731 • Clostridium acetobutylicum str. DSM 1731
Historical synonyms & basionyms	Anaerobic spore-forming late butyric and solventogenic blowing defect agent ; Co-agent sporulé anaérobie du gonflement tardif butyrique et solvanté • Bacteria
Taxonomic authority & reference strains	Clostridium acetobutylicum McCoy et al. 1926 (Approved Lists 1980)
Official sources & reference book	TaxID:991791 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Lineage & phylogenomic justification	Bacillota (phylum) › Clostridia (class) › Eubacteriales (order) › Clostridiaceae (family) › Clostridium (genus)
PubMed taxonomic references	PMID:20382436 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2010.02.020 🔎

INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture Palier 3

🔎 SQLite Proof

Vigilance category & defect diagnosis	Co-agent sporulé anaérobie du gonflement tardif butyrique et solvanté • Fentes internes horizontales (lainure), cavernes gazeuses déchiquetées et odeur mixte d'acide butyrique rance et de solvants (butanol/acétone)
Spoilage metabolites & taxonomic lineage	Fermentation biphasique acidogène (acide butyrique, acide acétique, CO2 et H2) puis solvantogène (butanol, acétone, éthanol) des glucides et du lactate
Documented substrates & historical synonyms	Propreté des fourrages et exclusion des ensilages butyriques, dégermination par bactofugation ou crémage et emploi de lysozyme en cuve • Anaérobiose stricte à cœur, pH supérieur à 5.2, T° de cave supérieure à 14 °C, présence de sucres résiduels et de lactates, spores issues de l'ensilage
Official sources & reference book	TaxID:991791 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Reference strain collections	DSM 792, ATCC 824, NCIMB 8052, CIP 103308
Operator safety & PubMed references	PMID:20382436 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2010.02.020 🔎

INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture Palier 4

🔎 SQLite Proof

Bacteriocins (NPClassifier) & health targets	Anaerobic spore-forming late butyric and solventogenic blowing defect agent ; Co-agent sporulé anaérobie du gonflement tardif butyrique et solvanté • Bacteria
Isolation substrates & linked cheese matrices	Pâtes pressées cuites et demi-cuites (Grana Padano, Parmigiano Reggiano, Emmental, Comté, Gouda) • Bacillota (phylum) › Clostridia (class) › Eubacteriales (order) › Clostridiaceae (family) › Clostridium (genus)
Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA)	Clostridium acetobutylicum McCoy et al. 1926 (Approved Lists 1980) • Clostridium acetobutylicum ATCC 4259 • Clostridium acetobutylicum strain DSM 1731 • Clostridium acetobutylicum str. DSM 1731
Official sources & reference book	TaxID:991791 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxis & PubMed references	PMID:20382436 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2010.02.020 🔎

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste

NCBI Synonyms & Basionyms	Clostridium acetobutylicum ATCC 4259 • Clostridium acetobutylicum strain DSM 1731 • Clostridium acetobutylicum str. DSM 1731

Palier 5 • Expert Absolu

EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures	PDB #1VL0 (25 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
NCBI RefSeq Genomic Assembly	RefSeq: GCA_000218855.1 • Taille: 4.14558 Mb • GC: 30.8866 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN02603396 • BioProject: PRJNA63241
PubMed / DOI Primary Literature	PMID:20382436 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2010.02.020 🔎