Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #48984 • NO RANK • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #48984
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Pantoea agglomerans pv. gypsophilae "Bacterium herbicola" Geilinger 1921
🌍 Plant-borne coliform early blowing and yellow cortical spot defect agent ; Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 1 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Erwiniaceae (family)
› Pantoea (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages au lait cru à pâte molle ou pressée non cuite (Saint-Nectaire, Tomme, Cantal, Reblochon), fromages de chèvre
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Pantoea agglomerans pv. gypsophilae ⟷ Erwinia herbicola pv. gypsophilae • Erwinia herbicola pv. gypsophila |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Plant-borne coliform early blowing and yellow cortical spot defect agent ; Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Bacterium herbicola" Geilinger 1921 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:48984 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Erwiniaceae (family) › Pantoea (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales • Ouverture précoce irrégulière en petits trous, colonies ou taches jaunâtres sous la croûte et goût herbeux-amer |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Fermentation acide mixte des sucres du lait libérant CO2 et H2 et biosynthèse de caroténoïdes membranaires (zéaxanthine et ses glucosides) |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Distribution des fourrages après la traite (réduction de l'empoussièrement), hygiène des trayons, refroidissement immédiat du lait et levains actifs • Contamination du lait par les poussières de foin, de paille ou de céréales lors de la traite, acidification initiale lente en cuve (pH supérieur à 5.4) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:48984 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 3493, ATCC 27155, NCTC 9381, CIP 57.51 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Plant-borne coliform early blowing and yellow cortical spot defect agent ; Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Fromages au lait cru à pâte molle ou pressée non cuite (Saint-Nectaire, Tomme, Cantal, Reblochon), fromages de chèvre • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Erwiniaceae (family) › Pantoea (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | "Bacterium herbicola" Geilinger 1921 • Erwinia herbicola pv. gypsophilae • Erwinia herbicola pv. gypsophila |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:48984 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Erwinia herbicola pv. gypsophilae • Erwinia herbicola pv. gypsophila |
|---|
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1C7G (1 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_001661985.2 • Taille: 5.03421 Mb • GC: 54.8225 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN04961658 • BioProject: PRJNA320975 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |