Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #549 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #549
← Retour au portail
Pantoea agglomerans "Bacterium herbicola" Geilinger 1921
🌍 Plant-borne coliform early blowing and yellow cortical spot defect agent ; Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 9 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Erwiniaceae (family)
› Pantoea (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages au lait cru à pâte molle ou pressée non cuite (Saint-Nectaire, Tomme, Cantal, Reblochon), fromages de chèvre
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Pantoea agglomerans ⟷ Bacterium herbicola • Enterobacter agglomerans • Erwinia herbicola • Erwinia milletiae (Kawakami and Yoshida 1920) Magrou 1937 (Approved Lists 1980) • Erwinia milletiae • Pantoea herbicola • Pseudomonas herbicola |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Plant-borne coliform early blowing and yellow cortical spot defect agent ; Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Bacterium herbicola" Geilinger 1921 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:549 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Erwiniaceae (family) › Pantoea (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales • Ouverture précoce irrégulière en petits trous, colonies ou taches jaunâtres sous la croûte et goût herbeux-amer |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Fermentation acide mixte des sucres du lait libérant CO2 et H2 et biosynthèse de caroténoïdes membranaires (zéaxanthine et ses glucosides) |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Distribution des fourrages après la traite (réduction de l'empoussièrement), hygiène des trayons, refroidissement immédiat du lait et levains actifs • Contamination du lait par les poussières de foin, de paille ou de céréales lors de la traite, acidification initiale lente en cuve (pH supérieur à 5.4) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:549 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 3493, ATCC 27155, NCTC 9381, CIP 57.51 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Plant-borne coliform early blowing and yellow cortical spot defect agent ; Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Fromages au lait cru à pâte molle ou pressée non cuite (Saint-Nectaire, Tomme, Cantal, Reblochon), fromages de chèvre • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Erwiniaceae (family) › Pantoea (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | "Bacterium herbicola" Geilinger 1921 • Bacterium herbicola • Enterobacter agglomerans • Erwinia herbicola • Erwinia milletiae (Kawakami and Yoshida 1920) Magrou 1937 (Approved Lists 1980) • Erwinia milletiae • Pantoea herbicola • Pseudomonas herbicola |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:549 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales
DEFAUT_PATE_GAZ_FENTES🔎 Preuve
Ouverture précoce irrégulière en petits trous, colonies ou taches jaunâtres sous la croûte et goût herbeux-amer
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Bacterium herbicola • Enterobacter agglomerans • Erwinia herbicola • Erwinia milletiae (Kawakami and Yoshida 1920) Magrou 1937 (Approved Lists 1980) • Erwinia milletiae • Pantoea herbicola • Pseudomonas herbicola |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (8) :
🦠 Pantoea agglomerans Eh318
#1408177
🦠 Pantoea agglomerans IG1
#1110694
🦠 Pantoea agglomerans NBRC 102470
#1220570
🦠 Pantoea agglomerans Tx10
#1332072
🦠 Pantoea agglomerans pv. betae
#77834
🦠 Pantoea agglomerans pv. gypsophilae
#48984
🦠 Pantoea agglomerans subsp. agglomerans
#3759081
🦠 Pantoea agglomerans subsp. jekyllhydei (SeqCode)
#3759082
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1C7G (9 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_019048385.1 • Taille: 4.69202 Mb • GC: 55.0741 % • Statut: Complete Genome • BioProject: PRJNA977094 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:26778304 🔎 • DOI:10.3168/jds.2015-10205 🔎 |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :