Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1075091 • STRAIN • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #1075091
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Clostridium sporogenes PA 3679 "Bacillus sporogenes" Metchnikoff 1908
🌍 Putrid blowing and white/grey rot defect agent ; Agent du gonflement putride et de la pourriture blanche
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 6 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Clostridia (class)
› Eubacteriales (order)
› Clostridiaceae (family)
› Clostridium (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes pressées cuites de longue garde (Comté, Emmental, Parmigiano Reggiano), fromages fondus
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Clostridium sporogenes PA 3679 ⟷ Clostridium sporogenes strain PA 3679 • Clostridium sporogenes str. PA 3679 |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Putrid blowing and white/grey rot defect agent ; Agent du gonflement putride et de la pourriture blanche • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Bacillus sporogenes" Metchnikoff 1908 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1075091 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Bacillota (phylum) › Clostridia (class) › Eubacteriales (order) › Clostridiaceae (family) › Clostridium (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:25825008 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-9091 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent du gonflement putride et de la pourriture blanche • Taches blanches crayeuses ou foyers grisâtres liquéfiés dans la pâte, cavernes fétides, odeur nauséabonde d'œuf pourri et de putréfaction |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Protéolyse anaérobie intense des caséines et réaction de Stickland sur les acides aminés libérant NH3, H2S, mercaptans, indoles et acides gras ramifiés |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Hygiène stricte de traite, dégermination physique du lait, maîtrise du salage et de la température en cave chaude • T° cave chaude > 16 °C, pH remonté (> 5.6), faible teneur en sel, spores très thermorésistantes |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1075091 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 795, ATCC 3584, NCIMB 10696, CIP 79.3 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:25825008 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-9091 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Putrid blowing and white/grey rot defect agent ; Agent du gonflement putride et de la pourriture blanche • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Pâtes pressées cuites de longue garde (Comté, Emmental, Parmigiano Reggiano), fromages fondus • Bacillota (phylum) › Clostridia (class) › Eubacteriales (order) › Clostridiaceae (family) › Clostridium (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | "Bacillus sporogenes" Metchnikoff 1908 • Clostridium sporogenes strain PA 3679 • Clostridium sporogenes str. PA 3679 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1075091 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:25825008 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-9091 🔎 |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Clostridium sporogenes strain PA 3679 • Clostridium sporogenes str. PA 3679 |
|---|
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #4Q0Y (6 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_000240115.1 • Taille: 4.18027 Mb • GC: 27.9 % • Statut: Scaffold • BioSample: SAMN02469693 • BioProject: PRJNA71727 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:25825008 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-9091 🔎 |