Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1219014 • STRAIN • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #1219014
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Rhodococcus erythropolis NBRC 15567 Arthrobacter picolinophilus Tate and Ensign 1974 (Approved Lists 1980)
🌍 Zoonotic opportunistic intracellular pathogen and salmon-pink mucoid rind contaminant ; Agent pathogène zoonotique opportuniste et agent de colonies muqueuses rose-saumon sur fromages au lait cru
⚡ 2 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum)
› Actinomycetes (class)
› Mycobacteriales (order)
› Nocardiaceae (family)
› Rhodococcus (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages frais et pâtes molles ou pressées non cuites au lait cru de chèvre, de brebis et de vache
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent pathogène zoonotique opportuniste et agent de colonies muqueuses rose-saumon sur fromages au lait cru • Parfois associé à des ponctuations muqueuses couleur saumon sur la croûte ; infections pulmonaires et systémiques opportunistes graves chez les sujets immunodéprimés |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Survie intramacrophagique médiée par les protéines associées à la virulence (VapA/VapB plasmidiques), synthèse de cholestérol oxydase et de caroténoïdes gamma-carotène |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Séparation stricte des équidés et des troupeaux laitiers, dépistage des mammites caprines/ovines, pasteurisation du lait et maîtrise de l'empoussièrement • Élevages mixtes ou sols riches en matière organique, résistance élevée à la dessiccation et aux acides grâce à la paroi mycolique, pH supérieur à 5.2 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1219014 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 20307, ATCC 6939, NCTC 1621, CIP 54.72 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Zoonotic opportunistic intracellular pathogen and salmon-pink mucoid rind contaminant ; Agent pathogène zoonotique opportuniste et agent de colonies muqueuses rose-saumon sur fromages au lait cru • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Fromages frais et pâtes molles ou pressées non cuites au lait cru de chèvre, de brebis et de vache • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Nocardiaceae (family) › Rhodococcus (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Arthrobacter picolinophilus Tate and Ensign 1974 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1219014 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1NU3 (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_001552595.1 • Taille: 6.58893 Mb • GC: 62.4 % • Statut: Contig • BioSample: SAMD00046519 • BioProject: PRJDB293 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |