Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1284 • SPECIES • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #1284
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Staphylococcus hyicus "Micrococcus hyicus" Sompolinsky 1953
🌍 Coagulase-variable mastitis agent and staphylococcal enterotoxin-producing pathogen ; Agent de mammite à staphylocoque coagulase-variable producteur d'entérotoxines thermostables
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 0 linked cheese matrix/matrices • 🧊 1 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Caryophanales (order)
› Staphylococcaceae (family)
› Staphylococcus (genus)
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages au lait cru de vache, de chèvre et de brebis à pâte molle ou pressée non cuite
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Staphylococcus hyicus ⟷ Micrococcus hyicus • Staphylococcus hyicus hyicus • Staphylococcus hyicus subsp. hyicus |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Coagulase-variable mastitis agent and staphylococcal enterotoxin-producing pathogen ; Agent de mammite à staphylocoque coagulase-variable producteur d'entérotoxines thermostables • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Micrococcus hyicus" Sompolinsky 1953 |
| Official sources & reference book | TaxID:1284 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:16957214 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent de mammite à staphylocoque coagulase-variable producteur d'entérotoxines thermostables • Aucune modification visuelle ou olfactive du fromage ; risque de toxi-infection alimentaire staphylococcique par synthèse d'entérotoxines classiques (SEA à SEE) |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Expression de gènes d'entérotoxines thermostables et de toxines exfoliatives (ExhA-D) lors de la multiplication en cuve à forte densité cellulaire (supérieure à 10^5 UFC/g) |
| Documented substrates & historical synonyms | Dépistage des mammites staphylococciques en élevage, refroidissement immédiat du lait cru et acidification lactique rapide dès l'emprésurage • Mammites subcliniques en élevage, ralentissement de l'acidification lactique en cuve (pH supérieur à 5.5 à 6 h), T° 25-40 °C, halotolérance jusqu'à 12 % NaCl |
| Official sources & reference book | TaxID:1284 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 20459, ATCC 11249, NCTC 10350, CIP 81.58 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:16957214 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Coagulase-variable mastitis agent and staphylococcal enterotoxin-producing pathogen ; Agent de mammite à staphylocoque coagulase-variable producteur d'entérotoxines thermostables • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Fromages au lait cru de vache, de chèvre et de brebis à pâte molle ou pressée non cuite • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | "Micrococcus hyicus" Sompolinsky 1953 • Micrococcus hyicus • Staphylococcus hyicus hyicus • Staphylococcus hyicus subsp. hyicus |
| Official sources & reference book | TaxID:1284 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:16957214 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
⚠️ Cellar Clinical Vigilance & Generic Defects Monitoring (1)
Differential diagnosis of potential defects, biochemical mechanisms and cellar prophylaxis (Tier 3 — Practitioner):
⚠️ Coagulase-variable mastitis agent and staphylococcal enterotoxin-producing pathogen
PATHOGENE_REGLEMENTAIRE_STRICT🔎 Proof
Aucune modification visuelle ou olfactive du fromage ; risque de toxi-infection alimentaire staphylococcique par synthèse d'entérotoxines classique…
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Micrococcus hyicus • Staphylococcus hyicus hyicus • Staphylococcus hyicus subsp. hyicus |
|---|
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #2HIH (1 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_000816085.1 • Taille: 2.47213 Mb • GC: 35.6 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN37948934 • BioProject: PRJNA779404 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:16957214 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |