Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1405 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #1405
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Bacillus mycoides Bacillus mycoides Flugge 1886 (Approved Lists 1980) emend. Liu et al. 2018
🌍 Sweet curdling and psychrotolerant vat destabilization agent ; Agent de la coagulation douce en cuve (caillage doux)
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 1 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Caryophanales (order)
› Bacillaceae (family)
› Bacillus (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Laits de fromagerie stockés au froid, pâtes molles, pâtes pressées, caillés lactiques
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Bacillus mycoides ⟷ Bacillus mycoides Flugge 1886 (Approved Lists 1980) • Bacillus weihenstephanensis |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Sweet curdling and psychrotolerant vat destabilization agent ; Agent de la coagulation douce en cuve (caillage doux) • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Bacillus mycoides Flugge 1886 (Approved Lists 1980) emend. Liu et al. 2018 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1405 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Bacillaceae (family) › Bacillus (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:9603849 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-4-1373 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent de la coagulation douce en cuve (caillage doux) • Coagulation prématurée du lait sans acidification (coagulation douce), synérèse défectueuse, grain fragile, amertume précoce du caillé |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Sécrétion de métalloprotéases extracellulaires (type chymosine-like) hydrolysant la caséine kappa et de phospholipases C déstabilisant la membrane des globules gras |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Limitation de la durée de garde du lait cru réfrigéré (< 36-48 h), propreté des fourrages et de la litière, microfiltration ou bactofugation • Stockage prolongé du lait réfrigéré (> 48 h à 4-7 °C), pH neutre à faiblement acide (6.0-6.7), spores thermorésistantes à la pasteurisation |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1405 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 11821, ATCC 700462, CIP 105579, WSBC 10204 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:9603849 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-4-1373 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Sweet curdling and psychrotolerant vat destabilization agent ; Agent de la coagulation douce en cuve (caillage doux) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Laits de fromagerie stockés au froid, pâtes molles, pâtes pressées, caillés lactiques • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Bacillaceae (family) › Bacillus (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Bacillus mycoides Flugge 1886 (Approved Lists 1980) emend. Liu et al. 2018 • Bacillus mycoides Flugge 1886 (Approved Lists 1980) • Bacillus weihenstephanensis |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1405 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:9603849 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-4-1373 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent de la coagulation douce en cuve (caillage doux)
ALTERATION_TECHNOLOGIQUE_CUVE🔎 Preuve
Coagulation prématurée du lait sans acidification (coagulation douce), synérèse défectueuse, grain fragile, amertume précoce du caillé
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Bacillus mycoides Flugge 1886 (Approved Lists 1980) • Bacillus weihenstephanensis |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (4) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #3VOU (1 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_018739485.1 • Taille: 5.69707 Mb • GC: 35.4311 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN39477583 • BioProject: PRJNA938905 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:9603849 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-4-1373 🔎 |