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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #1491 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #1491

Clostridium botulinum "Bacillus botulinus" van Ermengem 1896

🌍 Botulism neurotoxigenic spore-forming foodborne pathogen ; Agent pathogène sporulé du botulisme alimentaire

⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier

Bacillota (phylum) › Clostridia (class) › Eubacteriales (order) › Clostridiaceae (family) › Clostridium (genus)

Palier 3 • Praticien & Affineur

Fromages fondus, pâtes fraîches peu acides (Mascarpone), fromages conservés dans l'huile ou sous emballage anaérobie

INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

🔎 Preuve SQLite

Concordance de nomenclature (NCBI)	Clostridium botulinum ⟷ Bacillus botulinus • Bacillus putrificus • Botulobacillus botulinus • Clostridium botulinum subsp. botulinum • Clostridium putrificum • Ermengemillus botulinus • Pacinia putrifica
Synonymes & basionymes historiques	Botulism neurotoxigenic spore-forming foodborne pathogen ; Agent pathogène sporulé du botulisme alimentaire • Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence	"Bacillus botulinus" van Ermengem 1896
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1491 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique	Bacillota (phylum) › Clostridia (class) › Eubacteriales (order) › Clostridiaceae (family) › Clostridium (genus)
Références taxonomiques PubMed	PMID:9651303 🔎 • DOI:10.4315/0362-028X-61.6.738 🔎

INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

🔎 Preuve SQLite

Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut	Agent pathogène sporulé du botulisme alimentaire • Parfois associé à un gonflement gazeux et une odeur butyrique/putride (souches protéolytiques du groupe I), ou sans altération marquée ; danger mortel de paralysie flasque par neurotoxines botuliques
Métabolites d'altération & filiation taxonomique	Germination des spores thermorésistantes et synthèse des neurotoxines botuliques (BoNT types A, B, E) clivant les protéines SNARE synaptiques
Substrats documentés & synonymes historiques	Maîtrise combinée du triptyque pH/aw/sels de fonte (polyphosphates, citrates, nisine), maintien absolu de la chaîne du froid (inférieure à 4 °C) et barèmes stérilisants validés • Anaérobiose stricte, pH supérieur à 4.6 (notamment Mascarpone à pH 5.8-6.2 ou fromages fondus), aw supérieur à 0.94, rupture de réfrigération (T° supérieure à 10-12 °C pour le groupe I ou dès 3.3 °C pour le groupe II)
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1491 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Collections de souches de référence	ATCC 3502, NCTC 13319, CIP 104310 (Souche Hall)
Sécurité opérateur & références PubMed	PMID:9651303 🔎 • DOI:10.4315/0362-028X-61.6.738 🔎

INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

🔎 Preuve SQLite

Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires	Botulism neurotoxigenic spore-forming foodborne pathogen ; Agent pathogène sporulé du botulisme alimentaire • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées	Fromages fondus, pâtes fraîches peu acides (Mascarpone), fromages conservés dans l'huile ou sous emballage anaérobie • Bacillota (phylum) › Clostridia (class) › Eubacteriales (order) › Clostridiaceae (family) › Clostridium (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA)	"Bacillus botulinus" van Ermengem 1896 • Bacillus botulinus • Bacillus putrificus • Botulobacillus botulinus • Clostridium botulinum subsp. botulinum • Clostridium putrificum • Ermengemillus botulinus • Pacinia putrifica
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1491 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed	PMID:9651303 🔎 • DOI:10.4315/0362-028X-61.6.738 🔎

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :

PATHOGENE_REGLEMENTAIRE_STRICT🔎 Preuve

Parfois associé à un gonflement gazeux et une odeur butyrique/putride (souches protéolytiques du groupe I), ou sans altération marquée ; danger mor…

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste

Synonymes & Basionymes NCBI	Bacillus botulinus • Bacillus putrificus • Botulobacillus botulinus • Clostridium botulinum subsp. botulinum • Clostridium putrificum • Ermengemillus botulinus • Pacinia putrifica

🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (48) :

Palier 5 • Expert Absolu

Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB	PDB #1E1H (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq	RefSeq: GCA_000063585.1 • Taille: 3.90326 Mb • GC: 28.1941 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN03169473 • BioProject: PRJNA266242
Littérature primaire PubMed / DOI	PMID:9651303 🔎 • DOI:10.4315/0362-028X-61.6.738 🔎