Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #24 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #24
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Shewanella putrefaciens Alteromonas putrefaciens (ex Derby and Hammer) Lee et al. 1981
🌍 Major psychrotrophic putrid-sulfurous off-odor and pinkish-grey slime defect agent ; Agent psychrotrophe majeur d'odeur putride-sulfureuse et de décoloration rose-grisâtre
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 19 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Alteromonadales (order)
› Shewanellaceae (family)
› Shewanella (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages frais (Cottage cheese, Ricotta), pâtes filées (Mozzarella), pâtes molles à croûte lavée et saumures peu acides
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Shewanella putrefaciens ⟷ Alteromonas putrefaciens • Pseudomonas putrefaciens |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Major psychrotrophic putrid-sulfurous off-odor and pinkish-grey slime defect agent ; Agent psychrotrophe majeur d'odeur putride-sulfureuse et de décoloration rose-grisâtre • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Alteromonas putrefaciens (ex Derby and Hammer) Lee et al. 1981 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:24 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Alteromonadales (order) › Shewanellaceae (family) › Shewanella (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent psychrotrophe majeur d'odeur putride-sulfureuse et de décoloration rose-grisâtre • Odeur fétide d'œuf pourri (H2S), de poisson (triméthylamine) et de fromage transpiré (acide isovalérique), accompagnée d'une glaire rose-saumon à brun-grisâtre |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Réduction respiratoire anaérobie facultative du thiosulfate et de la cystéine en H2S, réduction de l'oxyde de triméthylamine (TMAO) en TMA et dégradation de la leucine |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Potabilisation et chloration/UV de l'eau de laiterie, maintien d'un pH inférieur à 5.2 dans les caillés et saumures, maîtrise stricte du froid • Psychrotrophie marquée (croissance dès 0-4 °C), tolérance au sel (jusqu'à 6-8 % NaCl), pH supérieur à 5.5, contamination d'origine hydrique |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:24 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 6067, ATCC 8071, NCTC 12960, CIP 80.40 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Major psychrotrophic putrid-sulfurous off-odor and pinkish-grey slime defect agent ; Agent psychrotrophe majeur d'odeur putride-sulfureuse et de décoloration rose-grisâtre • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Fromages frais (Cottage cheese, Ricotta), pâtes filées (Mozzarella), pâtes molles à croûte lavée et saumures peu acides • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Alteromonadales (order) › Shewanellaceae (family) › Shewanella (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Alteromonas putrefaciens (ex Derby and Hammer) Lee et al. 1981 • Alteromonas putrefaciens • Pseudomonas putrefaciens |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:24 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent psychrotrophe majeur d'odeur putride-sulfureuse et de décoloration rose-grisâtre
ALTERATION_GUSTATIVE_AROME🔎 Preuve
Odeur fétide d'œuf pourri (H2S), de poisson (triméthylamine) et de fromage transpiré (acide isovalérique), accompagnée d'une glaire rose-saumon à b…
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Alteromonas putrefaciens • Pseudomonas putrefaciens |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (2) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1J6Q (19 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_016406325.1 • Taille: 4.38633 Mb • GC: 44.4 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMEA111463821 • BioProject: PRJEB56269 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |