Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #253 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #253
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Chryseobacterium indologenes Chryseobacterium indologenes (Yabuuchi et al. 1983) Vandamme et al. 1994 emend. Montero-Calasanz et al. 2013
🌍 Psychrotrophic yellow-orange spot (flexirubin) and bitter proteolysis agent ; Agent psychrotrophe des taches jaunes-orangées (flexirubine) et d'amertume caséolytique
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 2 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacteroidota (phylum)
› Flavobacteriia (class)
› Flavobacteriales (order)
› Weeksellaceae (family)
› Chryseobacterium (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes filées (Mozzarella, Burrata), fromages frais, caillés doux et pâtes molles humides
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Chryseobacterium indologenes ⟷ Chryseobacterium indologenes (Yabuuchi et al. 1983) Vandamme et al. 1994 • Flavobacterium indologenes |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Psychrotrophic yellow-orange spot (flexirubin) and bitter proteolysis agent ; Agent psychrotrophe des taches jaunes-orangées (flexirubine) et d'amertume caséolytique • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Chryseobacterium indologenes (Yabuuchi et al. 1983) Vandamme et al. 1994 emend. Montero-Calasanz et al. 2013 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:253 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Bacteroidota (phylum) › Flavobacteriia (class) › Flavobacteriales (order) › Weeksellaceae (family) › Chryseobacterium (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent psychrotrophe des taches jaunes-orangées (flexirubine) et d'amertume caséolytique • Taches et colonies visqueuses jaune vif à orangé-brunâtre en surface du fromage (virant au rouge-brun en milieu alcalin), amertume et odeur d'indole |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Biosynthèse de pigments polyéniques arylés non caroténoïdes (flexirubine), production d'indole par la tryptophanase et sécrétion de métalloprotéases thermostables |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Potabilisation et traitement UV/filtration de l'eau de process, élimination des biofilms dans les échangeurs et tanks, acidification < pH 5.2 • Psychrotrophie (croissance dès 4 °C), contamination par l'eau de refroidissement/filage ou les biofilms laitiers, pH > 5.3 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:253 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 16777, ATCC 29897, CCUG 14483, CIP 101026 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Psychrotrophic yellow-orange spot (flexirubin) and bitter proteolysis agent ; Agent psychrotrophe des taches jaunes-orangées (flexirubine) et d'amertume caséolytique • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Pâtes filées (Mozzarella, Burrata), fromages frais, caillés doux et pâtes molles humides • Bacteroidota (phylum) › Flavobacteriia (class) › Flavobacteriales (order) › Weeksellaceae (family) › Chryseobacterium (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Chryseobacterium indologenes (Yabuuchi et al. 1983) Vandamme et al. 1994 emend. Montero-Calasanz et al. 2013 • Chryseobacterium indologenes (Yabuuchi et al. 1983) Vandamme et al. 1994 • Flavobacterium indologenes |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:253 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent psychrotrophe des taches jaunes-orangées (flexirubine) et d'amertume caséolytique
DEFAUT_PIGMENTAIRE_TACHES🔎 Preuve
Taches et colonies visqueuses jaune vif à orangé-brunâtre en surface du fromage (virant au rouge-brun en milieu alcalin), amertume et odeur d'indole
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Chryseobacterium indologenes (Yabuuchi et al. 1983) Vandamme et al. 1994 • Flavobacterium indologenes |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (1) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #3L6N (2 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_002025665.1 • Taille: 5.31475 Mb • GC: 35.9 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN10838879 • BioProject: PRJNA517586 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:28624852 🔎 • DOI:10.1016/j.fm.2017.06.004 🔎 |