Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #44454 • SUBSPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #44454
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Mycobacterium avium subsp. avium Mycobacterium avium subsp. avium Chester 1901
🌍 Paratuberculosis (Johne's disease) thermotolerant persistence agent in cheese ; Agent infectieux de la paratuberculose (maladie de Johne) persistant dans les fromages au lait cru
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum)
› Actinomycetes (class)
› Mycobacteriales (order)
› Mycobacteriaceae (family)
› Mycobacterium (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages au lait cru ou thermisé de vache, de chèvre et de brebis (pâtes molles, pâtes pressées non cuites et demi-cuites)
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Mycobacterium avium subsp. avium ⟷ Mycobacterium avium avium |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Paratuberculosis (Johne's disease) thermotolerant persistence agent in cheese ; Agent infectieux de la paratuberculose (maladie de Johne) persistant dans les fromages au lait cru • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Mycobacterium avium subsp. avium Chester 1901 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:44454 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Mycobacteriaceae (family) › Mycobacterium (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:15653520 🔎 • DOI:10.1128/AEM.71.3.1239-1247.2005 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent infectieux de la paratuberculose (maladie de Johne) persistant dans les fromages au lait cru • Aucune altération visuelle, texturale ou olfactive du fromage ; danger sanitaire surveillé (entérite granulomateuse des ruminants et lien épidémiologique étudié avec la maladie de Crohn) |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Paroi cellulaire riche en lipides complexes et acides mycoliques (mycobactine-dépendante pour la subsp. paratuberculosis) empêchant la lyse acide et saline pendant plusieurs mois d'affinage |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Certification et assainissement des cheptels vis-à-vis de la paratuberculose, hygiène stricte de la traite, microfiltration du lait et affinage prolongé • Troupeaux infectés par la paratuberculose, haute résistance thermique (survie partielle à la thermisation et à la pasteurisation basse en amas cellulaires) et tolérance à pH 4.5-5.0 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:44454 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 44156, ATCC 25291 (MAP : ATCC 19698, DSM 44133) |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:15653520 🔎 • DOI:10.1128/AEM.71.3.1239-1247.2005 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Paratuberculosis (Johne's disease) thermotolerant persistence agent in cheese ; Agent infectieux de la paratuberculose (maladie de Johne) persistant dans les fromages au lait cru • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Fromages au lait cru ou thermisé de vache, de chèvre et de brebis (pâtes molles, pâtes pressées non cuites et demi-cuites) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Mycobacteriaceae (family) › Mycobacterium (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Mycobacterium avium subsp. avium Chester 1901 • Mycobacterium avium avium |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:44454 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:15653520 🔎 • DOI:10.1128/AEM.71.3.1239-1247.2005 🔎 |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Mycobacterium avium avium |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (5) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #2N6G (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_009741445.1 • Taille: 4.95693 Mb • GC: 69.3 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN23242877 • BioProject: PRJNA231221 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:15653520 🔎 • DOI:10.1128/AEM.71.3.1239-1247.2005 🔎 |