Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #502800 • STRAIN • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #502800
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Yersinia pseudotuberculosis YPIII "Bacillus pseudotuberkulosis" (sic) Pfeiffer 1889
🌍 Psychrotrophic zoonotic enteric pseudotuberculosis foodborne pathogen ; Agent pathogène zoonotique psychrotrophe de la pseudotuberculose entérique
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 17 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Yersiniaceae (family)
› Yersinia (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Laits crus réfrigérés, fromages frais, caillés lactiques lents et pâtes molles au lait cru
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Yersinia pseudotuberculosis YPIII ⟷ Yersinia pseudotuberculosis strain YPIII • Yersinia pseudotuberculosis str. YPIII |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Psychrotrophic zoonotic enteric pseudotuberculosis foodborne pathogen ; Agent pathogène zoonotique psychrotrophe de la pseudotuberculose entérique • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Bacillus pseudotuberkulosis" (sic) Pfeiffer 1889 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:502800 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Yersiniaceae (family) › Yersinia (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent pathogène zoonotique psychrotrophe de la pseudotuberculose entérique • Aucune altération organoleptique détectable du fromage ; iléite terminale, adénite mésentérique pseudo-appendiculaire et érythème noueux |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Invasion cellulaire médiée par l'invasine chromosomique InvA, le plasmide de virulence pYV (effecteurs Yop) et le superantigène YPM |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Protection des fourrages et de l'eau contre les rongeurs/oiseaux, limitation de la garde du lait cru au froid, pasteurisation ou acidification franche • Psychrotrophie prononcée (multiplication active de 0 à 4 °C), contamination du lait ou de l'eau par la faune sauvage/rongeurs, pH supérieur à 5.0 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:502800 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 8992, ATCC 29833, NCTC 10275, CIP 55.85 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Psychrotrophic zoonotic enteric pseudotuberculosis foodborne pathogen ; Agent pathogène zoonotique psychrotrophe de la pseudotuberculose entérique • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Laits crus réfrigérés, fromages frais, caillés lactiques lents et pâtes molles au lait cru • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Yersiniaceae (family) › Yersinia (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | "Bacillus pseudotuberkulosis" (sic) Pfeiffer 1889 • Yersinia pseudotuberculosis strain YPIII • Yersinia pseudotuberculosis str. YPIII |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:502800 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎 |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Yersinia pseudotuberculosis strain YPIII • Yersinia pseudotuberculosis str. YPIII |
|---|
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #2XPD (17 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_000834375.1 • Taille: 4.68944 Mb • GC: 47.5 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN03144706 • BioProject: PRJNA239354 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎 |