STANDARD V14.4 • ROUTAGE O(1) Architecture relationnelle 24 pôles & 17 Index-Experts™ synchronisés avec la taxonomie NCBI 2026, EBI SIFTS 3D et cFMD/FMBN.
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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #51665 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #51665
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Aerococcus urinaeequi Pediococcus urinaeequi (ex Mees 1934) Garvie 1988

⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1))  •  🧀 2 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Aerococcaceae (family) › Aerococcus (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (2) :
🧀 Lactosérum 🧀 Queso Cotija

🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)

Palier 3 • Praticien & Affineur
Cheese metagenome (en:cheeses ; en:cotija-cheese ; en:whey — 6 échantillons)
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Synonymies et anciens noms (NCBI)

🔎 Preuve SQLite
Concordance de nomenclature (NCBI) Aerococcus urinaeequi (Pediococcus urinaeequi (ex Mees 1934) Garvie 1988)
Synonymes & basionymes historiques Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence Pediococcus urinaeequi (ex Mees 1934) Garvie 1988
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:51665 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Aerococcaceae (family) › Aerococcus (genus)
Références taxonomiques PubMed DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

Symptômes et défauts de fabrication

🔎 Preuve SQLite
Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut Bacteria • Queso Cotija [en:cotija-cheese], Lactosérum [en:whey]
Métabolites d'altération & filiation taxonomique Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Aerococcaceae (family) › Aerococcus (genus)
Substrats documentés & synonymes historiques Cheese metagenome (en:cheeses ; en:cotija-cheese ; en:whey — 6 échantillons) • Pediococcus urinaeequi (ex Mees 1934) Garvie 1988
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:51665 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Sécurité opérateur & références PubMed DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite
Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées Cheese metagenome (en:cheeses ; en:cotija-cheese ; en:whey — 6 échantillons) • Lactosérum / Whey [en:whey], Queso Cotija / Cotija cheese [en:cotija-cheese] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Aerococcaceae (family) › Aerococcus (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) Lactosérum (EST 96.49 %, MNA 3.53 %, NaCl 2.46 g/100g) ; Queso Cotija (EST 62.0 %, MNA 54.29 %, NaCl 3.56 g/100g) • Pediococcus urinaeequi (ex Mees 1934) Garvie 1988
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:51665 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet

🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu
Assemblage Génomique NCBI RefSeq RefSeq: GCA_001543205.1 • Taille: 2.01334 Mb • GC: 39.4 % • Statut: Complete Genome
Littérature primaire PubMed / DOI DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:cotija-cheese (n=2) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:whey (n=2) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:cheeses (n=2)