Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #51669 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #51669
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Tetragenococcus halophilus Pediococcus halophilus Mees 1934 (Approved Lists 1980)
🌍 Halophilic cheese-brine spoilage and histamine/tyramine accumulation agent ; Agent bactérien halophile des saumures anciennes responsable de trouble et d'histamine/tyramine
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 5 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Lactobacillales (order)
› Enterococcaceae (family)
› Tetragenococcus (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Saumures de fromagerie anciennes, fromages affinés en saumure (Feta, Domiati) et pâtes pressées saumurées
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Tetragenococcus halophilus ⟷ Pediococcus halophilus • Pediococcus soyae • Sarcina hamaguchiae • Tetracocccus No. 1 • Tetragenococcus halophila |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Halophilic cheese-brine spoilage and histamine/tyramine accumulation agent ; Agent bactérien halophile des saumures anciennes responsable de trouble et d'histamine/tyramine • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Pediococcus halophilus Mees 1934 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:51669 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Enterococcaceae (family) › Tetragenococcus (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent bactérien halophile des saumures anciennes responsable de trouble et d'histamine/tyramine • Trouble persistant et dépôt visqueux dans les bacs de saumure, pénétration corticale et accumulation d'histamine et de tyramine dans la croûte et le sous-croûte |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Fermentation homolactique halophile des sucres résiduels et décarboxylation enzymatique de l'L-histidine (HDC plasmidique) et de la L-tyrosine en milieu hypersalin |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Clarification par microfiltration ou pasteurisation périodique des saumures, maîtrise de la charge organique azotée des bains et maintien d'un pH voisin de 5.0 • Halophilie marquée (croissance optimale entre 5 et 18 % NaCl, tolérance jusqu'à 25 % NaCl), pH 5.0-7.5, accumulation d'azote soluble dans les bains de salage |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:51669 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 20339, ATCC 33315, NCIMB 1635, CIP 103247 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Halophilic cheese-brine spoilage and histamine/tyramine accumulation agent ; Agent bactérien halophile des saumures anciennes responsable de trouble et d'histamine/tyramine • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Saumures de fromagerie anciennes, fromages affinés en saumure (Feta, Domiati) et pâtes pressées saumurées • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Enterococcaceae (family) › Tetragenococcus (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Pediococcus halophilus Mees 1934 (Approved Lists 1980) • Pediococcus halophilus • Pediococcus soyae • Sarcina hamaguchiae • Tetracocccus No. 1 • Tetragenococcus halophila |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:51669 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (2)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent bactérien halophile des saumures anciennes responsable de trouble et d'histamine
ALTERATION_SAUMURE_HALOPHILE🔎 Preuve
Trouble persistant et dépôt visqueux dans les bacs de saumure, pénétration corticale et accumulation d'histamine et de tyramine dans la croûte et l…
⚠️ Tyramine
ALTERATION_SAUMURE_HALOPHILE🔎 Preuve
Trouble persistant et dépôt visqueux dans les bacs de saumure, pénétration corticale et accumulation d'histamine et de tyramine dans la croûte et l…
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Pediococcus halophilus • Pediococcus soyae • Sarcina hamaguchiae • Tetracocccus No. 1 • Tetragenococcus halophila |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (4) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #8XW5 (5 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_001712815.1 • Taille: 2.38947 Mb • GC: 36 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN23027267 • BioProject: PRJNA764004 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎 |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :