Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #766142 • STRAIN • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #766142
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Shigella dysenteriae 155-74 "Bacillus dysenteriae" Shiga 1898
🌍 Shiga toxin-producing bacillary dysentery strict regulatory foodborne pathogen ; Agent pathogène réglementaire producteur de toxine de Shiga (dysenterie bacillaire épidémique et SHU)
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 8 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Enterobacteriaceae (family)
› Shigella (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages frais, caillés doux, pâtes molles et fromages manipulés manuellement ou lavés avec une eau contaminée
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Shigella dysenteriae 155-74 ⟷ Shigella dysenteriae strain 155-74 |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Shiga toxin-producing bacillary dysentery strict regulatory foodborne pathogen ; Agent pathogène réglementaire producteur de toxine de Shiga (dysenterie bacillaire épidémique et SHU) • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Bacillus dysenteriae" Shiga 1898 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:766142 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Shigella (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/S0168-1605(00)00293-2 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent pathogène réglementaire producteur de toxine de Shiga (dysenterie bacillaire épidémique et SHU) • Absence totale de modification sensorielle du fromage ; dysenterie hémorragique grave et syndrome hémolytique et urémique (dose infectieuse très faible de 10 cellules) |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Production de la toxine de Shiga (Stx, inhibant la sous-unité 60S ribosomale endothéliale), invasion épithéliale via le plasmide pINV et système de résistance acide Gad |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Hygiène stricte des opérateurs, exclusion des porteurs, potabilisation contrôlée de l'eau d'atelier et pasteurisation du lait • Contamination interhumaine ou hydrique, forte acidotolérance permettant la survie pendant plusieurs semaines à pH 4.5-5.0 dans les fromages réfrigérés |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:766142 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 4781, ATCC 13313, NCTC 4837, CIP 57.28 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/S0168-1605(00)00293-2 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Shiga toxin-producing bacillary dysentery strict regulatory foodborne pathogen ; Agent pathogène réglementaire producteur de toxine de Shiga (dysenterie bacillaire épidémique et SHU) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Fromages frais, caillés doux, pâtes molles et fromages manipulés manuellement ou lavés avec une eau contaminée • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Shigella (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | "Bacillus dysenteriae" Shiga 1898 • Shigella dysenteriae strain 155-74 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:766142 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/S0168-1605(00)00293-2 🔎 |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Shigella dysenteriae strain 155-74 |
|---|
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1DM0 (8 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_000211935.2 • Taille: 5.1626 Mb • GC: 50.8 % • Statut: Contig • BioSample: SAMN00792439 • BioProject: PRJNA49063 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/S0168-1605(00)00293-2 🔎 |