Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #994476 • STRAIN • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #994476
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Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r) "Bacterium enterocoliticum" Schleifstein and Coleman 1939
🌍 Psychrotrophic enteric yersiniosis foodborne pathogen ; Agent pathogène psychrotrophe de la yersiniose entérique
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Yersiniaceae (family)
› Yersinia (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages frais, pâtes molles au lait cru ou recontaminées post-pasteurisation, laits de fromagerie
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r) ⟷ Yersinia enterocolitica subsp. palearctica str. 105.5R(r) • Yersinia enterocolitica subsp. palearctica strain 105.5R(r) |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Psychrotrophic enteric yersiniosis foodborne pathogen ; Agent pathogène psychrotrophe de la yersiniose entérique • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Bacterium enterocoliticum" Schleifstein and Coleman 1939 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:994476 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Yersiniaceae (family) › Yersinia (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent pathogène psychrotrophe de la yersiniose entérique • Aucune altération visuelle ou olfactive détectable du fromage ; gastro-entérite aiguë fébrile et adénite mésentérique (sérotypes pathogènes porteurs du plasmide pYV) |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Expression de l'uréase (neutralisation de l'acidité locale) et synthèse de l'entérotoxine thermostable Yst et des facteurs d'invasion Ail/YadA |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Hygiène stricte de la traite et de l'eau en ferme, pasteurisation maîtrisée, acidification lactique rapide en cuve (< pH 5.0) et prévention des recontaminations • Psychrotrophie prononcée (multiplication active de 0 à 4 °C), ralentissement de l'acidification lactique (pH > 5.2), tolérance jusqu'à 5 % NaCl |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:994476 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 4780, ATCC 9610, NCTC 10460, CIP 80.27 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Psychrotrophic enteric yersiniosis foodborne pathogen ; Agent pathogène psychrotrophe de la yersiniose entérique • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Fromages frais, pâtes molles au lait cru ou recontaminées post-pasteurisation, laits de fromagerie • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Yersiniaceae (family) › Yersinia (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | "Bacterium enterocoliticum" Schleifstein and Coleman 1939 • Yersinia enterocolitica subsp. palearctica str. 105.5R(r) • Yersinia enterocolitica subsp. palearctica strain 105.5R(r) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:994476 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎 |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Yersinia enterocolitica subsp. palearctica str. 105.5R(r) • Yersinia enterocolitica subsp. palearctica strain 105.5R(r) |
|---|
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1LYV (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_000192105.1 • Taille: 4.62181 Mb • GC: 46.9578 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN02603637 • BioProject: PRJNA53341 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎 |