Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1833 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #1833
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Rhodococcus erythropolis Arthrobacter picolinophilus Tate and Ensign 1974 (Approved Lists 1980)
🌍 Zoonotic opportunistic intracellular pathogen and salmon-pink mucoid rind contaminant ; Agent pathogène zoonotique opportuniste et agent de colonies muqueuses rose-saumon sur fromages au lait cru
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum)
› Actinomycetes (class)
› Mycobacteriales (order)
› Nocardiaceae (family)
› Rhodococcus (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages frais et pâtes molles ou pressées non cuites au lait cru de chèvre, de brebis et de vache
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Rhodococcus erythropolis ⟷ Arthrobacter hydrocarboglutamicus • Arthrobacter oxamicetus subsp. propiophenicolus • Arthrobacter oxamicetus • Arthrobacter paraffineus • Arthrobacter picolinophilus • Brevibacterium healii • Brevibacterium ketoglutamicum • Brevibacterium paraffinoliticum • Corynebacterium alkanum • Corynebacterium aurantiacum |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Zoonotic opportunistic intracellular pathogen and salmon-pink mucoid rind contaminant ; Agent pathogène zoonotique opportuniste et agent de colonies muqueuses rose-saumon sur fromages au lait cru • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Arthrobacter picolinophilus Tate and Ensign 1974 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1833 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Nocardiaceae (family) › Rhodococcus (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent pathogène zoonotique opportuniste et agent de colonies muqueuses rose-saumon sur fromages au lait cru • Parfois associé à des ponctuations muqueuses couleur saumon sur la croûte ; infections pulmonaires et systémiques opportunistes graves chez les sujets immunodéprimés |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Survie intramacrophagique médiée par les protéines associées à la virulence (VapA/VapB plasmidiques), synthèse de cholestérol oxydase et de caroténoïdes gamma-carotène |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Séparation stricte des équidés et des troupeaux laitiers, dépistage des mammites caprines/ovines, pasteurisation du lait et maîtrise de l'empoussièrement • Élevages mixtes ou sols riches en matière organique, résistance élevée à la dessiccation et aux acides grâce à la paroi mycolique, pH supérieur à 5.2 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1833 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 20307, ATCC 6939, NCTC 1621, CIP 54.72 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Zoonotic opportunistic intracellular pathogen and salmon-pink mucoid rind contaminant ; Agent pathogène zoonotique opportuniste et agent de colonies muqueuses rose-saumon sur fromages au lait cru • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Fromages frais et pâtes molles ou pressées non cuites au lait cru de chèvre, de brebis et de vache • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Nocardiaceae (family) › Rhodococcus (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Arthrobacter picolinophilus Tate and Ensign 1974 (Approved Lists 1980) • Arthrobacter hydrocarboglutamicus • Arthrobacter oxamicetus subsp. propiophenicolus • Arthrobacter oxamicetus • Arthrobacter paraffineus • Arthrobacter picolinophilus • Brevibacterium healii • Brevibacterium ketoglutamicum • Brevibacterium paraffinoliticum • Corynebacterium alkanum • Corynebacterium aurantiacum |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1833 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent pathogène zoonotique opportuniste et agent de colonies muqueuses rose-saumon sur fromages au lait cru
PATHOGENE_REGLEMENTAIRE_STRICT🔎 Preuve
Parfois associé à des ponctuations muqueuses couleur saumon sur la croûte ; infections pulmonaires et systémiques opportunistes graves chez les suj…
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Arthrobacter hydrocarboglutamicus • Arthrobacter oxamicetus subsp. propiophenicolus • Arthrobacter oxamicetus • Arthrobacter paraffineus • Arthrobacter picolinophilus • Brevibacterium healii • Brevibacterium ketoglutamicum • Brevibacterium paraffinoliticum • Corynebacterium alkanum • Corynebacterium aurantiacum |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (8) :
🦠 Rhodococcus erythropolis CCM2595
#1136179
🦠 Rhodococcus erythropolis DN1
#1381122
🦠 Rhodococcus erythropolis JCM 9803
#1298615
🦠 Rhodococcus erythropolis JCM 9804
#1302251
🦠 Rhodococcus erythropolis NBRC 15567
#1219014
🦠 Rhodococcus erythropolis PR4
#234621
🦠 Rhodococcus erythropolis R138
#1289591
🦠 Rhodococcus erythropolis XP
#1078016
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1NU3 (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_000696675.2 • Taille: 6.80651 Mb • GC: 62.3283 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN35083994 • BioProject: PRJNA783162 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |