Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #622 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #622
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Shigella dysenteriae "Bacillus dysenteriae" Shiga 1898
🌍 Shiga toxin-producing bacillary dysentery strict regulatory foodborne pathogen ; Agent pathogène réglementaire producteur de toxine de Shiga (dysenterie bacillaire épidémique et SHU)
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 8 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Enterobacteriaceae (family)
› Shigella (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages frais, caillés doux, pâtes molles et fromages manipulés manuellement ou lavés avec une eau contaminée
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Shigella dysenteriae ⟷ Bacillus dysenteriae • Bacillus dysentericus • Bacillus shigae • Eberthella dysenteriae • Escherichia/Shigella dysenteriae • Shigella shigae |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Shiga toxin-producing bacillary dysentery strict regulatory foodborne pathogen ; Agent pathogène réglementaire producteur de toxine de Shiga (dysenterie bacillaire épidémique et SHU) • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Bacillus dysenteriae" Shiga 1898 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:622 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Shigella (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/S0168-1605(00)00293-2 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent pathogène réglementaire producteur de toxine de Shiga (dysenterie bacillaire épidémique et SHU) • Absence totale de modification sensorielle du fromage ; dysenterie hémorragique grave et syndrome hémolytique et urémique (dose infectieuse très faible de 10 cellules) |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Production de la toxine de Shiga (Stx, inhibant la sous-unité 60S ribosomale endothéliale), invasion épithéliale via le plasmide pINV et système de résistance acide Gad |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Hygiène stricte des opérateurs, exclusion des porteurs, potabilisation contrôlée de l'eau d'atelier et pasteurisation du lait • Contamination interhumaine ou hydrique, forte acidotolérance permettant la survie pendant plusieurs semaines à pH 4.5-5.0 dans les fromages réfrigérés |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:622 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 4781, ATCC 13313, NCTC 4837, CIP 57.28 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/S0168-1605(00)00293-2 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Shiga toxin-producing bacillary dysentery strict regulatory foodborne pathogen ; Agent pathogène réglementaire producteur de toxine de Shiga (dysenterie bacillaire épidémique et SHU) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Fromages frais, caillés doux, pâtes molles et fromages manipulés manuellement ou lavés avec une eau contaminée • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Shigella (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | "Bacillus dysenteriae" Shiga 1898 • Bacillus dysenteriae • Bacillus dysentericus • Bacillus shigae • Eberthella dysenteriae • Escherichia/Shigella dysenteriae • Shigella shigae |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:622 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/S0168-1605(00)00293-2 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent pathogène réglementaire producteur de toxine de Shiga (dysenterie bacillaire épidémique et SHU)
PATHOGENE_REGLEMENTAIRE_STRICT🔎 Preuve
Absence totale de modification sensorielle du fromage ; dysenterie hémorragique grave et syndrome hémolytique et urémique (dose infectieuse très fa…
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Bacillus dysenteriae • Bacillus dysentericus • Bacillus shigae • Eberthella dysenteriae • Escherichia/Shigella dysenteriae • Shigella shigae |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (9) :
🦠 Shigella dysenteriae 155-74
#766142
🦠 Shigella dysenteriae 1617
#754093
🦠 Shigella dysenteriae 225-75
#766143
🦠 Shigella dysenteriae CDC 74-1112
#941429
🦠 Shigella dysenteriae S6554
#1212565
🦠 Shigella dysenteriae SD1D
#1353980
🦠 Shigella dysenteriae Sd197
#300267
🦠 Shigella dysenteriae WRSd3
#1401327
🦠 Shigella dysenteriae WRSd5
#1401259
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1DM0 (8 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_022354085.1 • Taille: 5.19267 Mb • GC: 50.6594 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN26526198 • BioProject: PRJNA629856 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/S0168-1605(00)00293-2 🔎 |