Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #4911 • SPECIES • Plants and Fungi
🔎 NCBI Certificate #4911
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Kluyveromyces marxianus Candida kefyr (Beij.) Uden & H.R. Buckley ex S.A. Mey. & Ahearn, 1983
⚡ 8 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 4 linked cheese matrix/matrices • 🧊 25 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Ascomycota (phylum)
› Saccharomycetes (class)
› Saccharomycetales (order)
› Saccharomycetaceae (family)
› Kluyveromyces (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (4) :
INDEX-EXPERT™ #00 • Tyrodexia™ Cheese Core
Palier 1
Master index of cheese starters and ripening cultures
🔎 SQLite Proof
| Associated dairy & cheese matrices | Neufchâtel [en:neufchatel-cheese-from-cow-s-milk], Mozzarella [en:mozzarella], Mozzarella di Bufala Campana [en:mozzarella-di-bufala-campana] |
|---|---|
| Paste typology & technological evidence | Levure fermentant le lactose dans les sacs d'égouttage et produisant des esters volatils fruités ; Levure thermotolérante présente dans le siero-innesto traditionnel de Campanie apportant de subtils esters floraux et fruités ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) • Plants and Fungi • Ascomycota (phylum) › Saccharomycetes (class) › Saccharomycetales (order) › Saccharomycetaceae (family) › Kluyveromyces (genus) |
| Secondary metabolites & reference collections | GCA_001417885.1 |
| Official sources & reference book | TaxID:4911 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Matrix TDM % & FDM % | Taille: 10.9665 Mb • GC: 40.1173 % • Candida kefyr (Beij.) Uden & H.R. Buckley ex S.A. Mey. & Ahearn, 1983 |
| Predatory bacteriophages & PubMed literature | PMID:16815620 🔎 • DOI:10.1016/j.idairyj.2005.10.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Kluyveromyces marxianus ⟷ Candida kefyr • Candida pseudotropicalis • Dekkeromyces marxianus • Guilliermondella marxiana • Kluyveromyces cicerisporus • Kluyveromyces fragilis • Saccharomyces kefyr • Saccharomyces marxianus • Zygofabospora marxiana • Zygorenospora marxiana |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Plants and Fungi |
| Taxonomic authority & reference strains | Candida kefyr (Beij.) Uden & H.R. Buckley ex S.A. Mey. & Ahearn, 1983 |
| Official sources & reference book | TaxID:4911 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Ascomycota (phylum) › Saccharomycetes (class) › Saccharomycetales (order) › Saccharomycetaceae (family) › Kluyveromyces (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:16815620 🔎 • DOI:10.1016/j.idairyj.2005.10.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #02 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 2
Ecological origins and habitats
🔎 SQLite Proof
| Cheese biotope, terroirs & isolation substrates | Mozzarella [en:mozzarella], Mozzarella di Bufala Campana [en:mozzarella-di-bufala-campana], Neufchâtel / Neufchâtel cheese from cow's milk [en:neufchatel-cheese-from-cow-s-milk] • Italie — Campanie — Molise ; France — Aubrac ; Pays-Bas — Schoonrewoerd — Dalfsen |
|---|---|
| Deposited strains & reference collections | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Levure thermotolérante présente dans le siero-innesto traditionnel de Campanie apportant de subtils esters floraux et fruités ; Levure fermentant le lactose dans les sacs d'égouttage et produisant des esters volatils fruités |
| Colonized matrix TDM % & FDM % | Mozzarella (EST 50.0 %, G/S 44.2 %) ; Mozzarella di Bufala Campana (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Mozzarella (EST 21.6 %, G/S 7.92 %) • Plants and Fungi |
| Official sources & reference book | TaxID:4911 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Ecology & PubMed references | PMID:16815620 🔎 • DOI:10.1016/j.idairyj.2005.10.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #04 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 1
Cheese families and technologies
🔎 SQLite Proof
| Technological family & associated appellations | Fromages italiens ; Fromages à pâte filée ; Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte pressée non cuite • Mozzarella [en:mozzarella], Mozzarella di Bufala Campana [en:mozzarella-di-bufala-campana], Neufchâtel / Neufchâtel cheese from cow's milk [en:neufchatel-cheese-from-cow-s-milk] |
|---|---|
| Paste/rind diagram & technological function | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Levure thermotolérante présente dans le siero-innesto traditionnel de Campanie apportant de subtils esters floraux et fruités ; Levure fermentant le lactose dans les sacs d'égouttage et produisant des esters volatils fruités • Ascomycota (phylum) › Saccharomycetes (class) › Saccharomycetales (order) › Saccharomycetaceae (family) › Kluyveromyces (genus) |
| Official sources & reference book | TaxID:4911 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Total dry matter (TDM %) & Fat in dry matter (FDM %) | Mozzarella (EST 50.0 %, G/S 44.2 %) ; Mozzarella di Bufala Campana (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Mozzarella (EST 21.6 %, G/S 7.92 %) • Plants and Fungi |
| Flagship cheeses (PDO / Caseus) & PubMed studies | Mozzarella (Spécialité traditionnelle garantie) ; Mozzarella di Bufala Campana (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • PMID:16815620 🔎 • DOI:10.1016/j.idairyj.2005.10.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #05 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Technological markers (pH and gas)
🔎 SQLite Proof
| Carbohydrate substrates, residual lactose (USDA) & metabolites | Protein : 22.2 g ; Ash : 3.28 g ; Eau : 50 g ; Lactose : 0 g • Mozzarella [en:mozzarella], Mozzarella di Bufala Campana [en:mozzarella-di-bufala-campana], Neufchâtel / Neufchâtel cheese from cow's milk [en:neufchatel-cheese-from-cow-s-milk] |
|---|---|
| Metabolic role & characterized compounds | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Levure thermotolérante présente dans le siero-innesto traditionnel de Campanie apportant de subtils esters floraux et fruités ; Levure fermentant le lactose dans les sacs d'égouttage et produisant des esters volatils fruités • Ascomycota (phylum) › Saccharomycetes (class) › Saccharomycetales (order) › Saccharomycetaceae (family) › Kluyveromyces (genus) |
| Draining, moisture, salting (USDA) & linked matrices | Mozzarella (EST 50.0 %, NaCl 1.23 g/100g) ; Mozzarella di Bufala Campana (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Mozzarella (EST 21.6 %, NaCl 0.1 g/100g) • Mozzarella [en:mozzarella], Mozzarella di Bufala Campana [en:mozzarella-di-bufala-campana], Neufchâtel / Neufchâtel cheese from cow's milk [en:neufchatel-cheese-from-cow-s-milk] |
| Official sources & reference book | TaxID:4911 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Vat phage monitoring & PubMed references | PMID:16815620 🔎 • DOI:10.1016/j.idairyj.2005.10.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Levure thermotolérante présente dans le siero-innesto traditionnel de Campanie apportant de subtils esters floraux et fruités ; Levure fermentant le lactose dans les sacs d'égouttage et produisant des esters volatils fruités • Plants and Fungi |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Mozzarella [en:mozzarella], Mozzarella di Bufala Campana [en:mozzarella-di-bufala-campana], Neufchâtel / Neufchâtel cheese from cow's milk [en:neufchatel-cheese-from-cow-s-milk] • Ascomycota (phylum) › Saccharomycetes (class) › Saccharomycetales (order) › Saccharomycetaceae (family) › Kluyveromyces (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Mozzarella (EST 50.0 %, MNA 64.18 %, NaCl 1.23 g/100g) ; Mozzarella di Bufala Campana (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Mozzarella (EST 21.6 %, MNA 79.76 %, NaCl 0.1 g/100g) • Candida kefyr (Beij.) Uden & H.R. Buckley ex S.A. Mey. & Ahearn, 1983 • Candida kefyr • Candida pseudotropicalis • Dekkeromyces marxianus • Guilliermondella marxiana • Kluyveromyces cicerisporus • Kluyveromyces fragilis • Saccharomyces kefyr • Saccharomyces marxianus • Zygofabospora marxiana • Zygorenospora marxiana |
| Official sources & reference book | TaxID:4911 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:16815620 🔎 • DOI:10.1016/j.idairyj.2005.10.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #09 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Surface interactomes and syntrophy
🔎 SQLite Proof
| Microbial consortium partners & matrices | Acinetobacter albensis (TaxID:1673609) ; Acinetobacter johnsonii (TaxID:40214) ; Aeromonas caviae (TaxID:648) ; Aeromonas salmonicida (TaxID:645) ; Chryseobacterium carnipullorum (TaxID:1124835) ; Chryseobacterium manosquense (TaxID:2754694) ; Escherichia coli (TaxID:562) ; Exiguobacterium acetylicum (TaxID:41170) • Mozzarella [en:mozzarella], Mozzarella di Bufala Campana [en:mozzarella-di-bufala-campana], Neufchâtel / Neufchâtel cheese from cow's milk [en:neufchatel-cheese-from-cow-s-milk] |
|---|---|
| Vitamin B1–B12 cofactors (USDA) & pigments | Folic acid : 0 µg ; Carotene, beta : 57 µg ; Carotene, alpha : 0 µg ; Cryptoxanthin, beta : 0 µg ; Lycopene : 0 µg |
| Rind typology & ripening succession | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Levure thermotolérante présente dans le siero-innesto traditionnel de Campanie apportant de subtils esters floraux et fruités ; Levure fermentant le lactose dans les sacs d'égouttage et produisant des esters volatils fruités |
| Official sources & reference book | TaxID:4911 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Consortium balance & PubMed studies | PMID:16815620 🔎 • DOI:10.1016/j.idairyj.2005.10.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #10 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 1
Terroirs and protected designations (PDO/PGI)
🔎 SQLite Proof
| Linked cheeses & dairy basins of origin | Mozzarella [en:mozzarella], Mozzarella di Bufala Campana [en:mozzarella-di-bufala-campana], Neufchâtel / Neufchâtel cheese from cow's milk [en:neufchatel-cheese-from-cow-s-milk] • Italie — Campanie — Molise ; France — Aubrac ; Pays-Bas — Schoonrewoerd — Dalfsen |
|---|---|
| Official designations (PDO/PGI) & rinds | Mozzarella (Spécialité traditionnelle garantie) ; Mozzarella di Bufala Campana (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • Ascomycota (phylum) › Saccharomycetes (class) › Saccharomycetales (order) › Saccharomycetaceae (family) › Kluyveromyces (genus) |
| Terroir cheesemakers & official awards | Candida kefyr (Beij.) Uden & H.R. Buckley ex S.A. Mey. & Ahearn, 1983 |
| Official sources & reference book | TaxID:4911 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Reference collections, BioSample & BioProject | SAMEA14035885 • PRJEB51073 |
| Terroir audit & PubMed references | PMID:16815620 🔎 • DOI:10.1016/j.idairyj.2005.10.008 🔎 |
⚠️ Cellar Clinical Vigilance & Generic Defects Monitoring (1)
Differential diagnosis of potential defects, biochemical mechanisms and cellar prophylaxis (Tier 3 — Practitioner):
⚠️ Yeast early blowing and alcoholic
DEFAUT_PATE_GAZ_FENTES🔎 Proof
Bombement des emballages, alvéoles gazeuses dans la pâte acide, odeur fermentée de levure, d'éthanol et d'acétate d'éthyle
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Candida kefyr • Candida pseudotropicalis • Dekkeromyces marxianus • Guilliermondella marxiana • Kluyveromyces cicerisporus • Kluyveromyces fragilis • Saccharomyces kefyr • Saccharomyces marxianus • Zygofabospora marxiana • Zygorenospora marxiana |
|---|
🔬 Subordinate strains and subspecies qualified in Tyrodexia™ (3) :
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #29NS (25 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_001417885.1 • Taille: 10.9665 Mb • GC: 40.1173 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMEA14035885 • BioProject: PRJEB51073 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:16815620 🔎 • DOI:10.1016/j.idairyj.2005.10.008 🔎 |
📊 Quantitative Metagenomic Detections (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :