Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #564422 • STRAIN • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #564422
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Pseudomonas fluorescens NZI7 "Bacillus fluorescens liquefaciens" Flugge 1886
🌍 Blue discoloration and fluorescent pigment defect agent ; Agent du défaut de coloration bleue/fluorescente des pâtes fraîches et filées
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 4 linked cheese matrix/matrices • 🧊 25 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Pseudomonadales (order)
› Pseudomonadaceae (family)
› Pseudomonas (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (4) :
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes filées (Mozzarella, Burrata), fromages frais, pâtes molles humides, Queso Fresco
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Pseudomonas fluorescens NZI7 ⟷ Pseudomonas fluorescens strain NZI7 • Pseudomonas fluorescens str. NZI7 |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Blue discoloration and fluorescent pigment defect agent ; Agent du défaut de coloration bleue/fluorescente des pâtes fraîches et filées • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Bacillus fluorescens liquefaciens" Flugge 1886 |
| Official sources & reference book | TaxID:564422 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent du défaut de coloration bleue/fluorescente des pâtes fraîches et filées • Taches et marbrures bleu roi, bleu-vert ou jaune-vert fluorescent à la surface du fromage et dans le liquide de couverture, glaire et amertume • Fiore sardo [it:fiore-sardo], Lactosérum [en:whey], Mozzarella [en:mozzarella], Pecorino [en:pecorino] |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Biosynthèse de pigments sidérophores hydrosolubles (pyoverdine fluorescente) et d'indigoidine (pigment bipyridyle bleu insoluble) sous stress oxydatif |
| Documented substrates & historical synonyms | Traitement UV, filtration stérilisante ou chloration/pasteurisation des eaux de filage et des liquides de couverture, maintien d'un pH < 5.2 • Psychrotrophie marquée (croissance dès 2-4 °C), pH > 5.4, eau de refroidissement ou liquide de gouverne contaminé, présence d'oxygène |
| Official sources & reference book | TaxID:564422 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 50090, ATCC 13525, NCTC 10038, CIP 69.13 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) • Blue discoloration and fluorescent pigment defect agent ; Agent du défaut de coloration bleue/fluorescente des pâtes fraîches et filées • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Pâtes filées (Mozzarella, Burrata), fromages frais, pâtes molles humides, Queso Fresco • Mozzarella [en:mozzarella], Fiore sardo [it:fiore-sardo], Pecorino [en:pecorino], Lactosérum / Whey [en:whey] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Mozzarella (EST 50.0 %, MNA 64.18 %, NaCl 1.23 g/100g) ; Fiore sardo (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Pecorino (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Lactosérum (EST 96.49 %, MNA 3.53 %, NaCl 2.46 g/100g) • "Bacillus fluorescens liquefaciens" Flugge 1886 • Pseudomonas fluorescens strain NZI7 • Pseudomonas fluorescens str. NZI7 |
| Official sources & reference book | TaxID:564422 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎 |
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Pseudomonas fluorescens strain NZI7 • Pseudomonas fluorescens str. NZI7 |
|---|
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #1A8S (25 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_000275905.1 • Taille: 6.81409 Mb • GC: 63.2 % • Statut: Contig • BioSample: SAMN02471730 • BioProject: PRJNA32039 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎 |