Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #648 • SPECIES • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #648
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Aeromonas caviae "Aeromonas caviae" Eddy 1962
🌍 Waterborne psychrotrophic enteropathogen and proteolytic slime spoilage agent ; Agent entéropathogène psychrotrophe d'origine hydrique et agent de glaire caséolytique des pâtes fraîches
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 2 linked cheese matrix/matrices • 🧊 16 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Aeromonadales (order)
› Aeromonadaceae (family)
› Aeromonas (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (2) :
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages frais à faible acidité (Queso Fresco, Cottage cheese, Ricotta), pâtes filées et fromages en saumure légère
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Aeromonas caviae ⟷ Aeromonas dourgesi anaerogene • Aeromonas formicans • Aeromonas hydrophila anaerogenes • Aeromonas hydrophila subsp. anaerogenes • Aeromonas punctata subsp. caviae • Aeromonas punctata subsp. punctata • Aeromonas punctata • Aeromonas punctata (Zimmermann 1890) Snieszko 1957 (Approved Lists 1980) • Pseudomonas caviae • Pseudomonas punctata |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Waterborne psychrotrophic enteropathogen and proteolytic slime spoilage agent ; Agent entéropathogène psychrotrophe d'origine hydrique et agent de glaire caséolytique des pâtes fraîches • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Aeromonas caviae" Eddy 1962 |
| Official sources & reference book | TaxID:648 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Aeromonadales (order) › Aeromonadaceae (family) › Aeromonas (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2004.05.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent entéropathogène psychrotrophe d'origine hydrique et agent de glaire caséolytique des pâtes fraîches • Glaire superficielle jaunâtre et amertume à forte charge ; gastro-entérite aiguë aqueuse ou dysentériforme chez le consommateur (notamment pédiatrique) • Provolone [en:provolone], Mozzarella [en:mozzarella] |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Sécrétion d'entérotoxines cytotoniques (Alt, Ast), d'hémolysines, de métalloprotéases caséolytiques et de lipases actives à basse température |
| Documented substrates & historical synonyms | Traitement bactéricide (chloration, UV, filtration stérilisante) de toutes les eaux en contact avec le fromage, acidification sous pH 5.0 et chaîne du froid • Psychrotrophie (croissance dès 2-4 °C), haute activité de l'eau (aw supérieur à 0.97), eau de process non traitée, pH supérieur à 5.2 |
| Official sources & reference book | TaxID:648 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 7323, ATCC 15468, NCTC 10852, CIP 76.16 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2004.05.008 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) • Waterborne psychrotrophic enteropathogen and proteolytic slime spoilage agent ; Agent entéropathogène psychrotrophe d'origine hydrique et agent de glaire caséolytique des pâtes fraîches • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Fromages frais à faible acidité (Queso Fresco, Cottage cheese, Ricotta), pâtes filées et fromages en saumure légère • Mozzarella [en:mozzarella], Provolone [en:provolone] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Aeromonadales (order) › Aeromonadaceae (family) › Aeromonas (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Mozzarella (EST 50.0 %, MNA 64.18 %, NaCl 1.23 g/100g) ; Provolone (EST 59.0 %, MNA 55.86 %, NaCl 1.85 g/100g) • "Aeromonas caviae" Eddy 1962 • Aeromonas dourgesi anaerogene • Aeromonas formicans • Aeromonas hydrophila anaerogenes • Aeromonas hydrophila subsp. anaerogenes • Aeromonas punctata subsp. caviae • Aeromonas punctata subsp. punctata • Aeromonas punctata • Aeromonas punctata (Zimmermann 1890) Snieszko 1957 (Approved Lists 1980) • Pseudomonas caviae • Pseudomonas punctata |
| Official sources & reference book | TaxID:648 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2004.05.008 🔎 |
⚠️ Cellar Clinical Vigilance & Generic Defects Monitoring (1)
Differential diagnosis of potential defects, biochemical mechanisms and cellar prophylaxis (Tier 3 — Practitioner):
⚠️ Waterborne psychrotrophic enteropathogen and proteolytic slime spoilage agent
PATHOGENE_REGLEMENTAIRE_STRICT🔎 Proof
Glaire superficielle jaunâtre et amertume à forte charge ; gastro-entérite aiguë aqueuse ou dysentériforme chez le consommateur (notamment pédiatri…
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Aeromonas dourgesi anaerogene • Aeromonas formicans • Aeromonas hydrophila anaerogenes • Aeromonas hydrophila subsp. anaerogenes • Aeromonas punctata subsp. caviae • Aeromonas punctata subsp. punctata • Aeromonas punctata • Aeromonas punctata (Zimmermann 1890) Snieszko 1957 (Approved Lists 1980) • Pseudomonas caviae • Pseudomonas punctata |
|---|
🔬 Subordinate strains and subspecies qualified in Tyrodexia™ (2) :
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #1IQ6 (16 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_900476005.1 • Taille: 4.58614 Mb • GC: 61.6 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN28749489 • BioProject: PRJNA843551 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:10984049 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2004.05.008 🔎 |
📊 Quantitative Metagenomic Detections (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :