Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #762633 • STRAIN • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #762633
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Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 Thermus thermophilus (ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995
🌍 Thermophilic pink discoloration defect (sub-rind pink ring) agent ; Agent thermophile du défaut de coloration rose (anneau rose sous-cortical)
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 4 linked cheese matrix/matrices • 🧊 25 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Deinococcota (phylum)
› Deinococci (class)
› Thermales (order)
› Thermaceae (family)
› Thermus (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (4) :
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes pressées cuites et demi-cuites (Emmental, Gruyère, Comté, Grana, Gouda), Cheddar
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 ⟷ Thermus thermophilus strain SG0.5JP17-16 • Thermus thermophilus str. SG0.5JP17-16 |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Thermophilic pink discoloration defect (sub-rind pink ring) agent ; Agent thermophile du défaut de coloration rose (anneau rose sous-cortical) • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | Thermus thermophilus (ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995 |
| Official sources & reference book | TaxID:762633 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Deinococcota (phylum) › Deinococci (class) › Thermales (order) › Thermaceae (family) › Thermus (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:27006458 🔎 • DOI:10.1128/mBio.00189-16 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent thermophile du défaut de coloration rose (anneau rose sous-cortical) • Bande ou anneau rose saumon diffus à 1-2 cm sous la croûte ou taches roses internes dans la pâte, sans altération majeure de la texture • Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Caciocavallo Silano [en:caciocavallo-silano], Blue cheese [en:blue-cheese], Bries [en:bries] |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Biosynthèse de caroténoïdes rouges/roses (thermaxanthine et dérivés) stimulée par les conditions d'oxydoréduction et la co-culture avec la flore lactique thermophile |
| Documented substrates & historical synonyms | Maîtrise microbiologique des réseaux d'eau chaude sanitaire (> 80 °C ou chloration/UV) et nettoyage spécifique des pasteurisateurs et écrémeuses de lactosérum • Thermophilie extrême (survie et enrichissement dans les échangeurs thermiques, le lactosérum chaud et l'eau chaude sanitaire à 55-75 °C), interaction avec les lactobacilles |
| Official sources & reference book | TaxID:762633 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 579, ATCC 27634, CIP 104443 (Souche HB8) |
| Operator safety & PubMed references | PMID:27006458 🔎 • DOI:10.1128/mBio.00189-16 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) • Thermophilic pink discoloration defect (sub-rind pink ring) agent ; Agent thermophile du défaut de coloration rose (anneau rose sous-cortical) • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Pâtes pressées cuites et demi-cuites (Emmental, Gruyère, Comté, Grana, Gouda), Cheddar • Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Caciocavallo Silano [en:caciocavallo-silano], Bries [en:bries], Blue cheese [en:blue-cheese] • Deinococcota (phylum) › Deinococci (class) › Thermales (order) › Thermaceae (family) › Thermus (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Gorgonzolas (EST 57.6 %, MNA 59.47 %, NaCl 2.92 g/100g) ; Caciocavallo Silano (EST 20.2 %, MNA 83.39 %, NaCl 0.8 g/100g) ; Bries (EST 51.6 %, MNA 66.94 %, NaCl 1.6 g/100g) ; Blue cheese (EST 57.6 %, MNA 59.47 %, NaCl 2.92 g/100g) • Thermus thermophilus (ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995 • Thermus thermophilus strain SG0.5JP17-16 • Thermus thermophilus str. SG0.5JP17-16 |
| Official sources & reference book | TaxID:762633 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:27006458 🔎 • DOI:10.1128/mBio.00189-16 🔎 |
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Thermus thermophilus strain SG0.5JP17-16 • Thermus thermophilus str. SG0.5JP17-16 |
|---|
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #10PX (25 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_000214845.1 • Taille: 2.30323 Mb • GC: 68.6134 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN00713632 • BioProject: PRJNA51619 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:27006458 🔎 • DOI:10.1128/mBio.00189-16 🔎 |