Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1272 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #1272
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Kocuria varians Micrococcus varians Migula 1900 (Approved Lists 1980)
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 2 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 2 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum)
› Actinomycetes (class)
› Micrococcales (order)
› Micrococcaceae (family)
› Kocuria (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (2) :
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:whey — 6 échantillons)
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Kocuria varians (Micrococcus varians Migula 1900 (Approved Lists 1980)) |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Micrococcus varians Migula 1900 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1272 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Micrococcaceae (family) › Kocuria (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Bacteria • Lactosérum [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo] |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Micrococcaceae (family) › Kocuria (genus) |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:whey — 6 échantillons) • Micrococcus varians Migula 1900 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1272 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Sécurité opérateur & références PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (4 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:whey — 6 échantillons) • Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo] • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Micrococcaceae (family) › Kocuria (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Lactosérum (EST 96.49 %, MNA 3.53 %, NaCl 2.46 g/100g) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) • Micrococcus varians Migula 1900 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1272 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #2OA9 (2 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_002250745.2 • Taille: 2.82304 Mb • GC: 70.5 % • Statut: Complete Genome |
| Littérature primaire PubMed / DOI | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :