Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1292 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #1292
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Staphylococcus warneri Staphylococcus warneri Kloos and Schleifer 1975
🌍 Subclinical mastitis agent causing impaired curd syneresis, lipolytic rancidity and tyramine ; Agent de mammite subclinique responsable de défaut de coagulation, de rancissement et de tyramine
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 6 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Caryophanales (order)
› Staphylococcaceae (family)
› Staphylococcus (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Laits de fromagerie de vache, chèvre et brebis, pâtes pressées non cuites et pâtes molles au lait cru
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Staphylococcus warneri (Staphylococcus warneri Kloos and Schleifer 1975) |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Subclinical mastitis agent causing impaired curd syneresis, lipolytic rancidity and tyramine ; Agent de mammite subclinique responsable de défaut de coagulation, de rancissement et de tyramine • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Staphylococcus warneri Kloos and Schleifer 1975 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1292 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent de mammite subclinique responsable de défaut de coagulation, de rancissement et de tyramine • Ralentissement de la synérèse en cuve, pâte humide, notes rances-savonneuses et accumulation de tyramine et de phényléthylamine en fin d'affinage |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Activation de la plasmine native du lait via l'inflammation mammaire, sécrétion de lipases/estérases extracellulaires et activité aminoacide décarboxylase |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Hygiène de la traite (trempage post-traite des trayons), maîtrise des mammites subcliniques, refroidissement immédiat du lait et levains actifs • Infection intramammaire subclinique ou contamination cutanée, halotolérance élevée (jusqu'à 12-15 % NaCl), survie à la thermisation |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1292 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 20316, ATCC 27836, NCTC 11044, CIP 81.65 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Subclinical mastitis agent causing impaired curd syneresis, lipolytic rancidity and tyramine ; Agent de mammite subclinique responsable de défaut de coagulation, de rancissement et de tyramine • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Laits de fromagerie de vache, chèvre et brebis, pâtes pressées non cuites et pâtes molles au lait cru • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Staphylococcus warneri Kloos and Schleifer 1975 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1292 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent de mammite subclinique responsable de défaut de coagulation et d'accumulation de tyramine
ALTERATION_TECHNOLOGIQUE_CUVE🔎 Preuve
Ralentissement de la coagulation et de l'égouttage en cuve, goût rance-amer et accumulation de tyramine, d'histamine et de 2-phényléthylamine • Ral…
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (6) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #4QC6 (6 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_003571725.1 • Taille: 2.54163 Mb • GC: 32.8633 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN11389228 • BioProject: PRJNA294605 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |