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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #1613 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #1613

Limosilactobacillus fermentum "Bacillus casei d" von Freudenreich and Thoni 1904

🌍 Thermophilic heterofermentative lactic gas-blowing and slit defect agent ; Agent lactique hétérofermentaire thermophile du gonflement gazeux et des fentes

⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 10 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 7 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier

Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Limosilactobacillus (genus)

🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (10) :

🧀 Bitto 🧀 Caciocavallo 🧀 Caciocavallo Silano 🧀 Fontina 🧀 Lactosérum 🧀 Mozzarella 🧀 Parmigiano Reggiano 🧀 Pecorino 🧀 Provolone 🧀 Provolone del monaco

🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)

Palier 3 • Praticien & Affineur

Pâtes filées (Mozzarella, Caciocavallo, Provolone), Cheddar, pâtes pressées cuites (Emmental, Gruyère)

INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Synonymies et anciens noms (NCBI)

🔎 Preuve SQLite

Concordance de nomenclature (NCBI)	Limosilactobacillus fermentum ⟷ Bacillus casei d • Bacillus d • Lactobacillus cellobiosus • Lactobacillus fermentum • Lactobacterium fermentum
Synonymes & basionymes historiques	Thermophilic heterofermentative lactic gas-blowing and slit defect agent ; Agent lactique hétérofermentaire thermophile du gonflement gazeux et des fentes • Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence	"Bacillus casei d" von Freudenreich and Thoni 1904
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1613 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique	Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Limosilactobacillus (genus)
Références taxonomiques PubMed	PMID:32293557 🔎 • DOI:10.1099/ijsem.0.004107 🔎

INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

Symptômes et défauts de fabrication

🔎 Preuve SQLite

Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut	Agent lactique hétérofermentaire thermophile du gonflement gazeux et des fentes • Alvéoles gazeuses précoces à intermédiaires, fentes internes (slits), bombement des emballages et goût acide-vinaigré • Provolone [en:provolone], Parmigiano Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Caciocavallo [en:caciocavallo], Caciocavallo Silano [en:caciocavallo-silano], Provolone del monaco [it:provolone-del-monaco], Fontina [en:fontina]
Métabolites d'altération & filiation taxonomique	Voie de la 6-phosphogluconate/phosphocétolase convertissant le glucose et le galactose en lactate, éthanol/acétate et CO2, plus hydrolyse de l'arginine (voie ADI : NH3 + CO2)
Substrats documentés & synonymes historiques	Utilisation de levains Streptococcus thermophilus Gal-positifs, maîtrise du refroidissement après filage ou pressage et hygiène des saumures/moulages • Thermorésistance au chauffage en cuve et au filage (croissance jusqu'à 45 °C), présence de galactose résiduel et d'arginine
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1613 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Collections de souches de référence	DSM 20052, ATCC 14931, NCTC 12447, CIP 102980
Sécurité opérateur & références PubMed	PMID:32293557 🔎 • DOI:10.1099/ijsem.0.004107 🔎

INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite

Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires	Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (4 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (38 éch.) • Thermophilic heterofermentative lactic gas-blowing and slit defect agent ; Agent lactique hétérofermentaire thermophile du gonflement gazeux et des fentes • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées	Pâtes filées (Mozzarella, Caciocavallo, Provolone), Cheddar, pâtes pressées cuites (Emmental, Gruyère) • Bitto [it:bitto], Fontina [en:fontina], Mozzarella [en:mozzarella], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Caciocavallo Silano [en:caciocavallo-silano], Provolone del monaco [it:provolone-del-monaco], Pecorino [en:pecorino], Provolone [en:provolone] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Limosilactobacillus (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA)	Bitto (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, MNA 55.01 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Mozzarella (EST 50.0 %, MNA 64.18 %, NaCl 1.23 g/100g) ; Parmigiano Reggiano (EST 77.4 %, MNA 31.3 %, NaCl 4.57 g/100g) • "Bacillus casei d" von Freudenreich and Thoni 1904 • Bacillus casei d • Bacillus d • Lactobacillus cellobiosus • Lactobacillus fermentum • Lactobacterium fermentum
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1613 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed	PMID:32293557 🔎 • DOI:10.1099/ijsem.0.004107 🔎

⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :

⚠️ Agent lactique hétérofermentaire thermophile du gonflement gazeux et des fentes

DEFAUT_PATE_GAZ_FENTES🔎 Preuve

Alvéoles gazeuses précoces à intermédiaires, fentes internes (slits), bombement des emballages et goût acide-vinaigré

Consulter la fiche clinique 360° →

🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste

Synonymes & Basionymes NCBI	Bacillus casei d • Bacillus d • Lactobacillus cellobiosus • Lactobacillus fermentum • Lactobacterium fermentum

🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (11) :

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu

Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB	PDB #4LQL (7 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq	RefSeq: GCA_029961225.1 • Taille: 2.10333 Mb • GC: 51.618 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN10365393 • BioProject: PRJNA503586
Littérature primaire PubMed / DOI	PMID:32293557 🔎 • DOI:10.1099/ijsem.0.004107 🔎

📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :

Organisme d'autorité
Dump officiel source
Table relationnelle SQLite
Clé primaire officielle