Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1703 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #1703
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Brevibacterium linens "Bacterium linens" Wolff 1910
⚡ 9 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 25 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 1 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum)
› Actinomycetes (class)
› Micrococcales (order)
› Brevibacteriaceae (family)
› Brevibacterium (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (25) :
🧀 Alfred le fermier
🧀 Appenzeller
🧀 Bleu d'Élizabeth
🧀 Brie de Melun
🧀 Cheddars
🧀 Comté
🧀 Gruyère
🧀 Hercule de Charlevoix
🧀 Louis d'Or
🧀 Maroilles
🧀 Morbiers
🧀 Munsters
🧀 Oka
🧀 Pied-De-Vent
🧀 Pikauba
🧀 Pionnier
🧀 Queso Cotija
🧀 Raclette du Valais
🧀 Raclettes
🧀 Saint-nectaire
🧀 Taleggio
🧀 Taliah
🧀 Tomme des Demoiselles
🧀 Vacherin fribourgeois
🧀 Valbert
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™
Palier 1
Index maître des ferments fromagers et affineurs
🔎 Preuve SQLite
| Matrices fromagères & substrats associés | Comté [en:comte], Gruyère [fr:gruyere], Brie de Melun [en:brie-de-melun], Munsters [en:munster], Maroilles [en:maroilles], Morbiers [en:morbier], Saint-nectaire [en:saint-nectaire], Taleggio [en:taleggio] |
|---|---|
| Typologie de pâte & preuves technologiques | Développement de la morge empesée brun-orangé par frottages salés réguliers et synthèse de thioesters ; Bactérie corynéforme majeure de la morge conférant la croûte grenée brun-ocre et les arômes soufrés typiques ; Développement soutenu des taches brun-orangé et des notes animales et fermentaires puissantes du Brie de Melun • Bacteria • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Métabolites secondaires & collections de référence | GCA_003999335.1 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1703 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| EST %, G/S % des matrices fromagères | Taille: 3.8143 Mb • GC: 64.7875 % • "Bacterium linens" Wolff 1910 |
| Bactériophages prédateurs & littérature PubMed | PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Brevibacterium linens ⟷ Bacterium linens |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Bacterium linens" Wolff 1910 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1703 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Origines et habitacles écologiques
🔎 Preuve SQLite
| Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Taliah [qc:taliah], Valbert [qc:valbert], Taleggio [en:taleggio], Pionnier [qc:pionnier], Pied-De-Vent / Pied-De-Vent (fromage) [qc:pied-de-vent], Alfred le fermier [qc:alfred-le-fermier], Tomme des Demoiselles [qc:tomme-des-demoiselles] • Italie ; Italie — Lombardie ; France — Indre-et-Loire — Vienne ; France — Rhône — Saône-et-Loire ; Turquie |
|---|---|
| Souches déposées & collections de référence | Ferment rouge historique implanté en 1893 à l'Abbaye Notre-Dame-du-Lac par le frère Alphonse Juin (originaire de Port-du-Salut), donnant la croûte cuivrée et l'arôme emblématique de l'Oka ; Formation de la croûte ocre brossée développant les arômes de paille sèche, de beurre salé et de noix ; Soins de morge réguliers à l'eau salée formant la croûte brune-ambrée grenée du Valbert |
| EST %, G/S % des matrices colonisées | Oka (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Taliah (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Valbert (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Taleggio (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) • Bacteria |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1703 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Écologie & références PubMed | PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Familles de fromages et technologies
🔎 Preuve SQLite
| Famille technologique & appellations associées | Fromages italiens ; Fromages de France ; Fromages de chèvre ; Fromages à pâte molle à croûte naturelle ; Burrata de vache • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Taliah [qc:taliah], Valbert [qc:valbert], Taleggio [en:taleggio], Pionnier [qc:pionnier], Pied-De-Vent / Pied-De-Vent (fromage) [qc:pied-de-vent], Alfred le fermier [qc:alfred-le-fermier], Tomme des Demoiselles [qc:tomme-des-demoiselles] |
|---|---|
| Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique | Ferment rouge historique implanté en 1893 à l'Abbaye Notre-Dame-du-Lac par le frère Alphonse Juin (originaire de Port-du-Salut), donnant la croûte cuivrée et l'arôme emblématique de l'Oka ; Formation de la croûte ocre brossée développant les arômes de paille sèche, de beurre salé et de noix ; Soins de morge réguliers à l'eau salée formant la croûte brune-ambrée grenée du Valbert • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1703 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices | Oka (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Taliah (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Valbert (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Taleggio (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) • Bacteria |
| Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed | Oka (Appellation d'origine protégée) ; Taliah (Appellation d'origine protégée) ; Valbert (Appellation d'origine protégée) ; Taleggio (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Ferment rouge historique implanté en 1893 à l'Abbaye Notre-Dame-du-Lac par le frère Alphonse Juin (originaire de Port-du-Salut), donnant la croûte cuivrée et l'arôme emblématique de l'Oka ; Formation de la croûte ocre brossée développant les arômes de paille sèche, de beurre salé et de noix ; Soins de morge réguliers à l'eau salée formant la croûte brune-ambrée grenée du Valbert • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Taliah [qc:taliah], Valbert [qc:valbert], Taleggio [en:taleggio], Pionnier [qc:pionnier], Pied-De-Vent / Pied-De-Vent (fromage) [qc:pied-de-vent], Alfred le fermier [qc:alfred-le-fermier], Tomme des Demoiselles [qc:tomme-des-demoiselles] • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Oka (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Taliah (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Valbert (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Taleggio (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) • "Bacterium linens" Wolff 1910 • Bacterium linens |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1703 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #09 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Interactomes et syntrophie des surfaces
🔎 Preuve SQLite
| Partenaires microbiens de consortium & matrices | Acidipropionibacterium acidipropionici (TaxID:1748) ; Acinetobacter albensis (TaxID:1673609) ; Acinetobacter baumannii (TaxID:470) ; Aerococcus urinaeequi (TaxID:51665) ; Agrococcus casei (TaxID:343512) ; Ancrocorticia populi (TaxID:2175228) ; Arthrobacter rhombi (TaxID:71253) ; Bavariicoccus seileri (TaxID:549685) • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Taliah [qc:taliah], Valbert [qc:valbert], Taleggio [en:taleggio], Pionnier [qc:pionnier], Pied-De-Vent / Pied-De-Vent (fromage) [qc:pied-de-vent] |
|---|---|
| Cofacteurs vitaminiques B1–B12 (USDA) & pigments | Vitamin A, IU : 496 IU ; Retinol : 40 µg ; Vitamin A, RAE : 58 µg ; Carotene, beta : 218 µg ; Carotene, alpha : 0 µg |
| Typologie des croûtes & succession d'affinage | Ferment rouge historique implanté en 1893 à l'Abbaye Notre-Dame-du-Lac par le frère Alphonse Juin (originaire de Port-du-Salut), donnant la croûte cuivrée et l'arôme emblématique de l'Oka ; Formation de la croûte ocre brossée développant les arômes de paille sèche, de beurre salé et de noix ; Soins de morge réguliers à l'eau salée formant la croûte brune-ambrée grenée du Valbert |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1703 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Équilibre du consortium & études PubMed | PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #10 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Terroirs et appellations protégées
🔎 Preuve SQLite
| Fromages reliés & bassins laitiers d'origine | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Taliah [qc:taliah], Valbert [qc:valbert], Taleggio [en:taleggio], Pionnier [qc:pionnier], Pied-De-Vent / Pied-De-Vent (fromage) [qc:pied-de-vent], Alfred le fermier [qc:alfred-le-fermier], Tomme des Demoiselles [qc:tomme-des-demoiselles] • Italie ; Italie — Lombardie ; France — Indre-et-Loire — Vienne ; France — Rhône — Saône-et-Loire ; Turquie |
|---|---|
| Appellations officielles (AOP/DOP/IGP) & croûtes | Oka (Appellation d'origine protégée) ; Taliah (Appellation d'origine protégée) ; Valbert (Appellation d'origine protégée) ; Taleggio (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Pionnier (Indicazione geografica protetta) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Fromageries de terroir & palmarès officiels | "Bacterium linens" Wolff 1910 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1703 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Collections de référence, BioSample & BioProject | SAMN21194356 • PRJNA543206 |
| Audit de terroir & références PubMed | PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #11 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Volatilome et profils aromatiques
🔎 Preuve SQLite
| Composés aromatiques ponts (FlavorGraph) & volatils | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Taliah [qc:taliah], Valbert [qc:valbert], Taleggio [en:taleggio], Pionnier [qc:pionnier], Pied-De-Vent / Pied-De-Vent (fromage) [qc:pied-de-vent] |
|---|---|
| Précurseurs lipidiques & aminés d'arômes (USDA) | Cholestérol : 30 mg ; Fatty acids, total saturated : 2.82 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 1.92 g ; MUFA 18:1 : 1.78 g ; Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g • Ferment rouge historique implanté en 1893 à l'Abbaye Notre-Dame-du-Lac par le frère Alphonse Juin (originaire de Port-du-Salut), donnant la croûte cuivrée et l'arôme emblématique de l'Oka ; Formation de la croûte ocre brossée développant les arômes de paille sèche, de beurre salé et de noix ; Soins de morge réguliers à l'eau salée formant la croûte brune-ambrée grenée du Valbert • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Accords gastronomiques & affinités sensorielles | Lasagna Noodle ; Manicotti ; Pepperoni ; Crushed Tomato ; Tomato Paste ; Ground Beef ; Bacon Bit |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1703 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Cinétique aromatique & études PubMed | PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #12 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Gestes de l'affineur et soins de cave
🔎 Preuve SQLite
| Conduite de croûte, soins de cave & matrices | Ferment rouge historique implanté en 1893 à l'Abbaye Notre-Dame-du-Lac par le frère Alphonse Juin (originaire de Port-du-Salut), donnant la croûte cuivrée et l'arôme emblématique de l'Oka ; Formation de la croûte ocre brossée développant les arômes de paille sèche, de beurre salé et de noix ; Soins de morge réguliers à l'eau salée formant la croûte brune-ambrée grenée du Valbert • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Taliah [qc:taliah], Valbert [qc:valbert], Taleggio [en:taleggio], Pionnier [qc:pionnier], Pied-De-Vent / Pied-De-Vent (fromage) [qc:pied-de-vent], Alfred le fermier [qc:alfred-le-fermier], Tomme des Demoiselles [qc:tomme-des-demoiselles] |
|---|---|
| Équilibre hydrique, extrait sec & salage (USDA) | Oka (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Taliah (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Valbert (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Taleggio (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) • Bacteria |
| Caves d'affinage, fromageries & régions | Italie ; Italie — Lombardie ; France — Indre-et-Loire — Vienne ; France — Rhône — Saône-et-Loire ; Turquie |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1703 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Études de cave & références PubMed | PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent des taches rouge-orangé indésirables et d'excès d'arômes soufrés-putrides hors pâtes lavées
DEFAUT_PIGMENTAIRE_TACHES🔎 Preuve
Taches et ponctuations visqueuses jaune-orangé à rouge brique sur des croûtes devant rester blanches ou sèches, odeur lourde de chou bouilli et d'a…
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Bacterium linens |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (1) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #7BCV (1 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_003999335.1 • Taille: 3.8143 Mb • GC: 64.7875 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN21194356 • BioProject: PRJNA543206 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:15545458 🔎 • DOI:10.1099/ijs.0.63166-0 🔎 |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :