Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1752 • SUBSPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #1752
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Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (van Niel 1928) Holdeman and Moore 1970
⚡ 10 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 13 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum)
› Actinomycetes (class)
› Propionibacteriales (order)
› Propionibacteriaceae (family)
› Propionibacterium (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (13) :
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™
Palier 1
Index maître des ferments fromagers et affineurs
🔎 Preuve SQLite
| Matrices fromagères & substrats associés | Comté [en:comte], Emmentals [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] |
|---|---|
| Typologie de pâte & preuves technologiques | Fermentation propionique du lactate en acides propionique et acétique avec dégagement de CO2 formant les yeux et les notes de noisette grillée ; Fermentation de Fitz transformant 3 moles de lactate en 2 moles de propionate, 1 mole d'acétate et 1 mole de CO2 formant les yeux de la taille d'une cerise à une noix ; Fermentation propionique douce en cave chaude apportant les arômes sucrés-fruités et une fine ouverture • Bacteria • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Propionibacteriales (order) › Propionibacteriaceae (family) › Propionibacterium (genus) |
| Métabolites secondaires & collections de référence | GCA_900016155.1 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| EST %, G/S % des matrices fromagères | Taille: 2.67504 Mb • GC: 67.2 % • Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (van Niel 1928) Holdeman and Moore 1970 |
| Bactériophages prédateurs & littérature PubMed | Phages: Propionibacterium phage Anatole, Propionibacterium phage B22, Propionibacterium phage B3, Propionibacterium phage B5, Propionibacterium phage Doucette, Propionibacterium phage E1 • PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii ⟷ Propionibacterium freudenreichii shermanii • Propionibacterium shermanii • Propionicibacterium freudenreichii subsp. shermanii |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (van Niel 1928) Holdeman and Moore 1970 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Propionibacteriales (order) › Propionibacteriaceae (family) › Propionibacterium (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Origines et habitacles écologiques
🔎 Preuve SQLite
| Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement | Comté [en:comte], Emmentals / Emmentaler [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] |
|---|---|
| Souches déposées & collections de référence | Fermentation propionique du lactate en acides propionique et acétique avec dégagement de CO2 formant les yeux et les notes de noisette grillée ; Fermentation de Fitz transformant 3 moles de lactate en 2 moles de propionate, 1 mole d'acétate et 1 mole de CO2 formant les yeux de la taille d'une cerise à une noix ; Fermentation propionique douce en cave chaude apportant les arômes sucrés-fruités et une fine ouverture |
| EST %, G/S % des matrices colonisées | Emmentals (EST 98.53 %, G/S 40.5 %) ; Louis d'Or (EST 21.6 %, G/S 7.92 %) • Bacteria |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Écologie & références PubMed | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #03 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Textures de pâte et rhéologie
🔎 Preuve SQLite
| Typologie de pâte/croûte & matrices reliées | Comté [en:comte], Emmentals / Emmentaler [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] • Fermentation propionique du lactate en acides propionique et acétique avec dégagement de CO2 formant les yeux et les notes de noisette grillée ; Fermentation de Fitz transformant 3 moles de lactate en 2 moles de propionate, 1 mole d'acétate et 1 mole de CO2 formant les yeux de la taille d'une cerise à une noix ; Fermentation propionique douce en cave chaude apportant les arômes sucrés-fruités et une fine ouverture |
|---|---|
| Profil protéolytique, acides aminés (USDA) & métabolites | Glutamic acid : 1.11 g ; Proline : 0.552 g ; Leucine : 0.484 g ; Lysine : 0.394 g • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Propionibacteriales (order) › Propionibacteriaceae (family) › Propionibacterium (genus) |
| Extrait sec (EST %), G/S %, ratio Ca/P & minéralisation | Emmentals (EST 98.53 %, G/S 40.5 %) ; Louis d'Or (EST 21.6 %, G/S 7.92 %) • Calcium, Ca : 17 mg ; Potassium, K : 166 mg ; Zinc, Zn : 0.08 mg ; Iron, Fe : 0.03 mg |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Guide clinique de la rhéologie fromagère et des matrices coagulées (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Références rhéologiques PubMed | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Familles de fromages et technologies
🔎 Preuve SQLite
| Famille technologique & appellations associées | Desserts lactés ; Entremets - mousses et crème desserts ; Yaourts • Comté [en:comte], Emmentals / Emmentaler [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] |
|---|---|
| Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique | Fermentation propionique du lactate en acides propionique et acétique avec dégagement de CO2 formant les yeux et les notes de noisette grillée ; Fermentation de Fitz transformant 3 moles de lactate en 2 moles de propionate, 1 mole d'acétate et 1 mole de CO2 formant les yeux de la taille d'une cerise à une noix ; Fermentation propionique douce en cave chaude apportant les arômes sucrés-fruités et une fine ouverture • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Propionibacteriales (order) › Propionibacteriaceae (family) › Propionibacterium (genus) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices | Emmentals (EST 98.53 %, G/S 40.5 %) ; Louis d'Or (EST 21.6 %, G/S 7.92 %) • Bacteria |
| Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #05 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Marqueurs technologiques (pH et gaz)
🔎 Preuve SQLite
| Substrats glucidiques, lactose résiduel (USDA) & métabolites | Total Sugars : 52.5 g ; Total lipid (fat) : 39.9 g ; Carbohydrate, by difference : 52.5 g ; Énergie : 577 kcal • Comté [en:comte], Emmentals / Emmentaler [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] |
|---|---|
| Rôle métabolique & composés caractérisés | Fermentation propionique du lactate en acides propionique et acétique avec dégagement de CO2 formant les yeux et les notes de noisette grillée ; Fermentation de Fitz transformant 3 moles de lactate en 2 moles de propionate, 1 mole d'acétate et 1 mole de CO2 formant les yeux de la taille d'une cerise à une noix ; Fermentation propionique douce en cave chaude apportant les arômes sucrés-fruités et une fine ouverture • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Propionibacteriales (order) › Propionibacteriaceae (family) › Propionibacterium (genus) |
| Égouttage, humidité, salage (USDA) & matrices reliées | Emmentals (EST 98.53 %, NaCl 0.31 g/100g) ; Louis d'Or (EST 21.6 %, NaCl 0.1 g/100g) • Comté [en:comte], Emmentals / Emmentaler [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Surveillance phagique en cuve & références PubMed | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Fermentation propionique du lactate en acides propionique et acétique avec dégagement de CO2 formant les yeux et les notes de noisette grillée ; Fermentation de Fitz transformant 3 moles de lactate en 2 moles de propionate, 1 mole d'acétate et 1 mole de CO2 formant les yeux de la taille d'une cerise à une noix ; Fermentation propionique douce en cave chaude apportant les arômes sucrés-fruités et une fine ouverture • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Comté [en:comte], Emmentals / Emmentaler [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Propionibacteriales (order) › Propionibacteriaceae (family) › Propionibacterium (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Emmentals (EST 98.53 %, MNA 2.45 %, NaCl 0.31 g/100g) ; Louis d'Or (EST 21.6 %, MNA 79.76 %, NaCl 0.1 g/100g) • Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (van Niel 1928) Holdeman and Moore 1970 • Propionibacterium freudenreichii shermanii • Propionibacterium shermanii • Propionicibacterium freudenreichii subsp. shermanii |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #10 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Terroirs et appellations protégées
🔎 Preuve SQLite
| Fromages reliés & bassins laitiers d'origine | Comté [en:comte], Emmentals / Emmentaler [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] |
|---|---|
| Appellations officielles (AOP/DOP/IGP) & croûtes | Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Propionibacteriales (order) › Propionibacteriaceae (family) › Propionibacterium (genus) |
| Fromageries de terroir & palmarès officiels | Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (van Niel 1928) Holdeman and Moore 1970 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Collections de référence, BioSample & BioProject | SAMEA4663402 • PRJEB23938 |
| Audit de terroir & références PubMed | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #11 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Volatilome et profils aromatiques
🔎 Preuve SQLite
| Composés aromatiques ponts (FlavorGraph) & volatils | Comté [en:comte], Emmentals / Emmentaler [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] |
|---|---|
| Précurseurs lipidiques & aminés d'arômes (USDA) | Fatty acids, total saturated : 36.7 g ; Phytosterols : 36 mg ; SFA 12:0 : 14.5 g ; SFA 18:0 : 9.41 g ; Glutamic acid : 1.11 g ; Proline : 0.552 g ; Leucine : 0.484 g • Fermentation propionique du lactate en acides propionique et acétique avec dégagement de CO2 formant les yeux et les notes de noisette grillée ; Fermentation de Fitz transformant 3 moles de lactate en 2 moles de propionate, 1 mole d'acétate et 1 mole de CO2 formant les yeux de la taille d'une cerise à une noix ; Fermentation propionique douce en cave chaude apportant les arômes sucrés-fruités et une fine ouverture • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Propionibacteriales (order) › Propionibacteriaceae (family) › Propionibacterium (genus) |
| Accords gastronomiques & affinités sensorielles | Egg |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Cinétique aromatique & études PubMed | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #14 • Science du lait & santé Tyrodexia™
Palier 4
Peptidome bioactif, santé fonctionnelle et vigilance clinique
🔎 Preuve SQLite
| Vitamines cardioprotectrices (USDA) & bioactifs | Folic acid : 0 µg ; Vitamin K (phylloquinone) : 9.9 µg ; Cryptoxanthin, beta : 0 µg ; Lycopene : 0 µg ; Carotene, alpha : 0 µg ; Vitamin E (alpha-tocopherol) : 1.52 mg |
|---|---|
| Acides aminés fonctionnels (GABA, Proline USDA) | Glutamic acid : 1.11 g ; Proline : 0.552 g ; Leucine : 0.484 g ; Lysine : 0.394 g ; Valine : 0.351 g ; Aspartic acid : 0.347 g • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Propionibacteriales (order) › Propionibacteriaceae (family) › Propionibacterium (genus) |
| Acides gras bioactifs (ALC, Oméga-3) & minéraux | Fatty acids, total saturated : 36.7 g ; Phytosterols : 36 mg ; SFA 12:0 : 14.5 g ; SFA 18:0 : 9.41 g ; Calcium, Ca : 17 mg ; Potassium, K : 166 mg ; Zinc, Zn : 0.08 mg ; Iron, Fe : 0.03 mg • Comté [en:comte], Emmentals / Emmentaler [en:emmentaler], Louis d'Or [qc:louis-d-or] |
| Extinction réelle du lactose & sucres (USDA) | Énergie : 577 kcal ; Eau : 1.47 g ; Fiber, total dietary : 0 g ; Protein : 4.9 g ; Ash : 1.17 g |
| Collections de référence, autorité & synonymes | Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (van Niel 1928) Holdeman and Moore 1970 • Propionibacterium freudenreichii shermanii • Propionibacterium shermanii • Propionicibacterium freudenreichii subsp. shermanii |
| Littérature scientifique PubMed | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:1752 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Propionibacterium freudenreichii shermanii • Propionibacterium shermanii • Propionicibacterium freudenreichii subsp. shermanii |
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🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (1) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1AR4 (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_900016155.1 • Taille: 2.67504 Mb • GC: 67.2 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMEA4663402 • BioProject: PRJEB23938 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:20636370 🔎 • DOI:10.1371/journal.pone.0011748 🔎 |