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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #1764 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #1764

Mycobacterium avium "Bacillus tuberculosis gallinarum" Sternberg 1892

🌍 Paratuberculosis (Johne's disease) thermotolerant persistence agent in cheese ; Agent infectieux de la paratuberculose (maladie de Johne) persistant dans les fromages au lait cru

⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier

Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Mycobacteriaceae (family) › Mycobacterium (genus)

🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)

Palier 3 • Praticien & Affineur

Fromages au lait cru ou thermisé de vache, de chèvre et de brebis (pâtes molles, pâtes pressées non cuites et demi-cuites)

INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Synonymies et anciens noms (NCBI)

🔎 Preuve SQLite

Concordance de nomenclature (NCBI)	Mycobacterium avium ⟷ Bacillus tuberculosis gallinarum • Mycobacterium tuberculosis avium • Mycobacterium tuberculosis typus gallinaceus • Tuberculose des oiseaux
Synonymes & basionymes historiques	Paratuberculosis (Johne's disease) thermotolerant persistence agent in cheese ; Agent infectieux de la paratuberculose (maladie de Johne) persistant dans les fromages au lait cru • Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence	"Bacillus tuberculosis gallinarum" Sternberg 1892
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1764 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique	Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Mycobacteriaceae (family) › Mycobacterium (genus)
Références taxonomiques PubMed	PMID:15653520 🔎 • DOI:10.1128/AEM.71.3.1239-1247.2005 🔎

INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

Symptômes et défauts de fabrication

🔎 Preuve SQLite

Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut	Agent infectieux de la paratuberculose (maladie de Johne) persistant dans les fromages au lait cru • Aucune altération visuelle, texturale ou olfactive du fromage ; danger sanitaire surveillé (entérite granulomateuse des ruminants et lien épidémiologique étudié avec la maladie de Crohn)
Métabolites d'altération & filiation taxonomique	Paroi cellulaire riche en lipides complexes et acides mycoliques (mycobactine-dépendante pour la subsp. paratuberculosis) empêchant la lyse acide et saline pendant plusieurs mois d'affinage
Substrats documentés & synonymes historiques	Certification et assainissement des cheptels vis-à-vis de la paratuberculose, hygiène stricte de la traite, microfiltration du lait et affinage prolongé • Troupeaux infectés par la paratuberculose, haute résistance thermique (survie partielle à la thermisation et à la pasteurisation basse en amas cellulaires) et tolérance à pH 4.5-5.0
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1764 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Collections de souches de référence	DSM 44156, ATCC 25291 (MAP : ATCC 19698, DSM 44133)
Sécurité opérateur & références PubMed	PMID:15653520 🔎 • DOI:10.1128/AEM.71.3.1239-1247.2005 🔎

INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite

Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires	Paratuberculosis (Johne's disease) thermotolerant persistence agent in cheese ; Agent infectieux de la paratuberculose (maladie de Johne) persistant dans les fromages au lait cru • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées	Fromages au lait cru ou thermisé de vache, de chèvre et de brebis (pâtes molles, pâtes pressées non cuites et demi-cuites) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Mycobacteriaceae (family) › Mycobacterium (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA)	"Bacillus tuberculosis gallinarum" Sternberg 1892 • Bacillus tuberculosis gallinarum • Mycobacterium tuberculosis avium • Mycobacterium tuberculosis typus gallinaceus • Tuberculose des oiseaux
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1764 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed	PMID:15653520 🔎 • DOI:10.1128/AEM.71.3.1239-1247.2005 🔎

⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :

⚠️ Agent infectieux de la paratuberculose (maladie de Johne) persistant dans les fromages au lait cru

PATHOGENE_REGLEMENTAIRE_STRICT🔎 Preuve

Aucune altération visuelle, texturale ou olfactive du fromage ; danger sanitaire surveillé (entérite granulomateuse des ruminants et lien épidémiol…

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🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste

Synonymes & Basionymes NCBI	Bacillus tuberculosis gallinarum • Mycobacterium tuberculosis avium • Mycobacterium tuberculosis typus gallinaceus • Tuberculose des oiseaux

🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (48) :

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu

Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB	PDB #2N6G (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq	RefSeq: GCA_022175585.2 • Taille: 5.17384 Mb • GC: 69 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN16339788 • BioProject: PRJNA666990
Littérature primaire PubMed / DOI	PMID:15653520 🔎 • DOI:10.1128/AEM.71.3.1239-1247.2005 🔎

Organisme d'autorité
Dump officiel source
Table relationnelle SQLite
Clé primaire officielle