Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #296 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #296
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Pseudomonas fragi
🌍 Psychrotrophic fruity-ester off-flavor and proteolytic destabilization agent ; Agent psychrotrophe du goût fruité-ester et de la déstabilisation protéolytique
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 4 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 11 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Pseudomonadales (order)
› Pseudomonadaceae (family)
› Pseudomonas (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (4) :
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Laits réfrigérés, fromages frais, pâtes molles, pâtes filées (Mozzarella) et pâtes pressées
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Pseudomonas fragi ⟷ Pseudomonas fragi (Eichholz 1902) Gruber 1905 (Approved Lists 1980) |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Psychrotrophic fruity-ester off-flavor and proteolytic destabilization agent ; Agent psychrotrophe du goût fruité-ester et de la déstabilisation protéolytique • Bacteria |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:296 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:19151189 🔎 • DOI:10.1128/AEM.01859-08 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent psychrotrophe du goût fruité-ester et de la déstabilisation protéolytique • Odeur anormale fruitée (fraise, pomme, ananas) évoluant vers le rance et le putride, amertume, baisse de rendement fromager et pâte collante • Lactosérum [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo], Mozzarella [en:mozzarella], Idiazabal [es:idiazabal] |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Estérification d'acides gras courts (acide butyrique, hexanoïque) avec l'éthanol en butyrate et hexanoate d'éthyle, et sécrétion de la métalloprotéase thermorésistante AprX |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Réfrigération rapide < 4 °C et transformation sous 36-48 h, NEP rigoureux des tanks de garde et camions-citernes, traitement de l'eau de process • Stockage prolongé du lait entre 2 et 7 °C (> 48 h), aérobiose, contamination par l'eau de rinçage ou les équipements froids |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:296 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 3456, ATCC 4973, NCTC 10689, CIP 55.5 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:19151189 🔎 • DOI:10.1128/AEM.01859-08 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (6 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (16 éch.) • Psychrotrophic fruity-ester off-flavor and proteolytic destabilization agent ; Agent psychrotrophe du goût fruité-ester et de la déstabilisation protéolytique • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Laits réfrigérés, fromages frais, pâtes molles, pâtes filées (Mozzarella) et pâtes pressées • Idiazabal [es:idiazabal], Mozzarella [en:mozzarella], Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Idiazabal (EST 19.3 %, MNA 86.77 %, NaCl 0.11 g/100g) ; Mozzarella (EST 50.0 %, MNA 64.18 %, NaCl 1.23 g/100g) ; Lactosérum (EST 96.49 %, MNA 3.53 %, NaCl 2.46 g/100g) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) • Pseudomonas fragi (Eichholz 1902) Gruber 1905 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:296 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:19151189 🔎 • DOI:10.1128/AEM.01859-08 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent psychrotrophe du goût fruité-ester et de la déstabilisation protéolytique
ALTERATION_GUSTATIVE_AROME🔎 Preuve
Odeur anormale fruitée (fraise, pomme, ananas) évoluant vers le rance et le putride, amertume, baisse de rendement fromager et pâte collante
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Pseudomonas fragi (Eichholz 1902) Gruber 1905 (Approved Lists 1980) |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (2) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1WDK (11 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_015476275.1 • Taille: 5.07721 Mb • GC: 59.2982 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMEA114444138 • BioProject: PRJEB65351 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:19151189 🔎 • DOI:10.1128/AEM.01859-08 🔎 |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :