Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #907 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #907
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Megasphaera elsdenii "Organism LC" Elsden and Lewis 1953
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 1 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 2 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Negativicutes (class)
› Veillonellales (order)
› Veillonellaceae (family)
› Megasphaera (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (1) :
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Cheese metagenome (en:kefir — 2 échantillons)
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Megasphaera elsdenii ("Organism LC" Elsden and Lewis 1953) |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Organism LC" Elsden and Lewis 1953 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:907 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Bacillota (phylum) › Negativicutes (class) › Veillonellales (order) › Veillonellaceae (family) › Megasphaera (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Bacteria • Kéfir [en:kefir] |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Bacillota (phylum) › Negativicutes (class) › Veillonellales (order) › Veillonellaceae (family) › Megasphaera (genus) |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Cheese metagenome (en:kefir — 2 échantillons) • "Organism LC" Elsden and Lewis 1953 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:907 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Sécurité opérateur & références PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Cheese metagenome (en:kefir — 2 échantillons) • Kéfir / Kefir [en:kefir] • Bacillota (phylum) › Negativicutes (class) › Veillonellales (order) › Veillonellaceae (family) › Megasphaera (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Kéfir (EST 10.3 %, MNA 90.62 %, NaCl 0.1 g/100g) • "Organism LC" Elsden and Lewis 1953 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:907 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1BUC (2 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_003010495.1 • Taille: 2.47894 Mb • GC: 52.8 % • Statut: Complete Genome |
| Littérature primaire PubMed / DOI | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :