Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #273384 • SPECIES • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #273384
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Brevibacterium aurantiacum Brevibacterium aurantiacum Gavrish et al. 2005
⚡ 10 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 35 linked cheese matrix/matrices • 🧊 2 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum)
› Actinomycetes (class)
› Micrococcales (order)
› Brevibacteriaceae (family)
› Brevibacterium (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (35) :
🧀 1608 (marque fromagère)
🧀 Abondance
🧀 Asiago
🧀 Blue cheese
🧀 Brie de Meaux cheeses
🧀 Bries
🧀 Caciotta
🧀 Castelmagno
🧀 Cheddar cheese
🧀 Chemin Hatley
🧀 Chèvre à ma manière
🧀 Fontina
🧀 Hard cheeses
🧀 Garrotxa cheese
🧀 Kénogami (fromage)
🧀 La Madelaine
🧀 Le Ménestrel
🧀 Livarot
🧀 Migneron de Charlevoix
🧀 Monte veronese
🧀 Parmigiano-Reggiano
🧀 Pecorino
🧀 Picon bejes tresviso
🧀 Pont-l'évêque
🧀 Queso camerano
🧀 Queso de la serena
🧀 Queso ibores
🧀 Queso palmero
🧀 Raclette
🧀 Reblochon
🧀 Saint-Nectaire
🧀 Stichelton
🧀 Taleggio
🧀 Tomme cheese from cow's milk
🧀 Époisses de Bourgogne
INDEX-EXPERT™ #00 • Tyrodexia™ Cheese Core
Palier 1
Master index of cheese starters and ripening cultures
🔎 SQLite Proof
| Associated dairy & cheese matrices | Abondance [en:abondance], Brie de Meaux [en:brie-de-meaux-cheeses], Reblochons [en:reblochon], Époisses [en:epoisses-de-bourgogne], Livarot [en:livarot], Pont-l'évêque [en:pont-l-eveque], 1608 [qc:1608], Migneron de Charlevoix [qc:migneron-de-charlevoix] |
|---|---|
| Paste typology & technological evidence | Pigmentation ambrée à cuivrée de la croûte morgée portant l'empreinte de la toile et biosynthèse de composés soufrés ; Apparition des pigmentations rougeâtres et ferments du rouge caractéristiques des Bries de Meaux affinés aux trois quarts ou à cœur ; Pigmentation jaune-orangé de la croûte lors du lavage après salage et apport des arômes de beurre noisette • Bacteria • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Secondary metabolites & reference collections | GCA_003932995.1 |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Matrix TDM % & FDM % | Taille: 4.03863 Mb • GC: 62.7 % • Brevibacterium aurantiacum Gavrish et al. 2005 |
| Predatory bacteriophages & PubMed literature | Phages: Brevibacterium phage 10C, Brevibacterium phage 1C, Brevibacterium phage 1T, Brevibacterium phage 2C, Brevibacterium phage 2T, Brevibacterium phage 3C |
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Brevibacterium aurantiacum (Brevibacterium aurantiacum Gavrish et al. 2005) |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | Brevibacterium aurantiacum Gavrish et al. 2005 |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
INDEX-EXPERT™ #02 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 2
Ecological origins and habitats
🔎 SQLite Proof
| Cheese biotope, terroirs & isolation substrates | Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Taleggio [en:taleggio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Castelmagno [it:castelmagno], Queso ibores [es:queso-ibores], Chemin Hatley [qc:chemin-hatley], Queso palmero [es:queso-palmero] • Italie ; Suisse ; Espagne — Province de Cáceres ; France — Aude — Gard ; Espagne |
|---|---|
| Deposited strains & reference collections | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (10 éch.) |
| Colonized matrix TDM % & FDM % | Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) ; Taleggio (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Castelmagno (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
INDEX-EXPERT™ #04 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 1
Cheese families and technologies
🔎 SQLite Proof
| Technological family & associated appellations | Fromages italiens ; Fromages de vache ; Fromages de chèvre ; Fromages espagnols ; Fromages de France • Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Taleggio [en:taleggio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Castelmagno [it:castelmagno], Queso ibores [es:queso-ibores], Chemin Hatley [qc:chemin-hatley], Queso palmero [es:queso-palmero] |
|---|---|
| Paste/rind diagram & technological function | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (10 éch.) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Total dry matter (TDM %) & Fat in dry matter (FDM %) | Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) ; Taleggio (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Castelmagno (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Flagship cheeses (PDO / Caseus) & PubMed studies | Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Fontina (Appellation d'origine protégée) ; Taleggio (Appellation d'origine protégée) ; Raclettes (Appellation d'origine protégée • Label Rouge) |
INDEX-EXPERT™ #05 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Technological markers (pH and gas)
🔎 SQLite Proof
| Carbohydrate substrates, residual lactose (USDA) & metabolites | Protein : 7.96 g ; Ash : 1.63 g ; Lactose : 1.91 g ; Fiber, total dietary : 1.4 g • Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Taleggio [en:taleggio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Castelmagno [it:castelmagno], Queso ibores [es:queso-ibores] |
|---|---|
| Metabolic role & characterized compounds | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (10 éch.) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Draining, moisture, salting (USDA) & linked matrices | Asiago (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Taleggio (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Castelmagno (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) • Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Taleggio [en:taleggio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Castelmagno [it:castelmagno], Queso ibores [es:queso-ibores] |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Vat phage monitoring & PubMed references | Phages: Brevibacterium phage 10C (TaxID:3043566), Brevibacterium phage 1C (TaxID:3043567), Brevibacterium phage 1T (TaxID:3043568), Brevibacterium phage 2C (TaxID:3043569), Brevibacterium phage 2T (TaxID:3043570) |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (10 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Taleggio [en:taleggio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Castelmagno [it:castelmagno], Queso ibores [es:queso-ibores], Chemin Hatley [qc:chemin-hatley], Queso palmero [es:queso-palmero] • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Asiago (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, MNA 55.01 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Taleggio (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Castelmagno (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) • Brevibacterium aurantiacum Gavrish et al. 2005 |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #09 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Surface interactomes and syntrophy
🔎 SQLite Proof
| Microbial consortium partners & matrices | Acidipropionibacterium jensenii (TaxID:1749) ; Acidovorax facilis (TaxID:12917) ; Acinetobacter albensis (TaxID:1673609) ; Acinetobacter baumannii (TaxID:470) ; Aeromonas rivipollensis (TaxID:948519) ; Agrococcus casei (TaxID:343512) ; Alkalibacterium gilvum (TaxID:1130080) ; Ancrocorticia populi (TaxID:2175228) • Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Taleggio [en:taleggio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Castelmagno [it:castelmagno], Queso ibores [es:queso-ibores] |
|---|---|
| Vitamin B1–B12 cofactors (USDA) & pigments | Vitamin A, IU : 496 IU ; Retinol : 40 µg ; Vitamin A, RAE : 58 µg ; Carotene, beta : 218 µg ; Carotene, alpha : 0 µg |
| Rind typology & ripening succession | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (10 éch.) |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
INDEX-EXPERT™ #10 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 1
Terroirs and protected designations (PDO/PGI)
🔎 SQLite Proof
| Linked cheeses & dairy basins of origin | Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Taleggio [en:taleggio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Castelmagno [it:castelmagno], Queso ibores [es:queso-ibores], Chemin Hatley [qc:chemin-hatley], Queso palmero [es:queso-palmero] • Italie ; Suisse ; Espagne — Province de Cáceres ; France — Aude — Gard ; Espagne |
|---|---|
| Official designations (PDO/PGI) & rinds | Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Fontina (Appellation d'origine protégée) ; Taleggio (Appellation d'origine protégée) ; Raclettes (Appellation d'origine protégée • Label Rouge) ; Castelmagno (Appellation d'origine protégée • denominazione di origine protetta • Indicazione geografica protetta) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Terroir cheesemakers & official awards | Brevibacterium aurantiacum Gavrish et al. 2005 |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Reference collections, BioSample & BioProject | SAMN23026999 • PRJNA764004 |
INDEX-EXPERT™ #11 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Volatilome and aromatic profiles
🔎 SQLite Proof
| Bridge aroma compounds (FlavorGraph) & volatiles | trimethylamine ; stearic acid ; salicylic acid ; propionic acid ; phenylacetaldehyde ; phenol ; palmitic acid ; oleic acid • Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Taleggio [en:taleggio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Castelmagno [it:castelmagno], Queso ibores [es:queso-ibores] |
|---|---|
| Lipid & amino acid aroma precursors (USDA) | Cholestérol : 30 mg ; Fatty acids, total saturated : 2.82 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 1.92 g ; MUFA 18:1 : 1.78 g ; Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g • Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (10 éch.) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Micrococcales (order) › Brevibacteriaceae (family) › Brevibacterium (genus) |
| Gastronomic pairings & sensory affinities | Speck ; Head Broccoli ; Genoa Salami ; Fusilli ; Focaccia Bread ; Artichoke Heart ; Baby Portabella Mushroom ; Salami |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #12 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 2
Affinage gestures and cellar care
🔎 SQLite Proof
| Rind management, cellar care & matrices | Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (14 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (10 éch.) • Asiago [en:asiago], Fontina [en:fontina], Taleggio [en:taleggio], Raclettes / Raclette [en:raclette], Castelmagno [it:castelmagno], Queso ibores [es:queso-ibores], Chemin Hatley [qc:chemin-hatley], Queso palmero [es:queso-palmero] |
|---|---|
| Moisture balance, dry matter & salting (USDA) | Asiago (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Taleggio (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Castelmagno (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) • Bacteria |
| Ripening cellars, cheesemakers & regions | Italie ; Suisse ; Espagne — Province de Cáceres ; France — Aude — Gard ; Espagne |
| Official sources & reference book | TaxID:273384 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #9HDE (2 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_003932995.1 • Taille: 4.03863 Mb • GC: 62.7 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN23026999 • BioProject: PRJNA764004 |
📊 Quantitative Metagenomic Detections (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheeses (n=380)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheddar-cheese (n=28)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:fontina (n=14)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:taleggio (n=10)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:parmigiano-reggiano (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:blue-cheese (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:hard-cheeses (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:tomme-cheese-from-cow-s-milk (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:pecorino (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:asiago (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:caciotta (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:bries (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:castelmagno (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:monte-veronese (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:stichelton (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:raclette (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:garrotxa-cheese (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:abondance (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
es:picon-bejes-tresviso (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
es:queso-camerano (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
es:queso-ibores (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
es:queso-palmero (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
es:queso-de-la-serena (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:saint-nectaire (n=2)