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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #1352 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #1352

Enterococcus faecium Enterococcus faecium (Orla-Jensen 1919) Schleifer and Kilpper-Balz 1984

🌍 Thermoduric post-acidification and tyramine accumulation agent ; Agent thermodurique de post-acidification et d'accumulation de tyramine

⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 5 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier

Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Enterococcaceae (family) › Enterococcus (genus)

🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (5) :

Palier 3 • Praticien & Affineur

Pâtes pressées non cuites et demi-cuites, pâtes molles et fromages méditerranéens

INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

🔎 Preuve SQLite

Concordance de nomenclature (NCBI)	Enterococcus faecium ⟷ Streptococcus faecium
Synonymes & basionymes historiques	Thermoduric post-acidification and tyramine accumulation agent ; Agent thermodurique de post-acidification et d'accumulation de tyramine • Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence	Enterococcus faecium (Orla-Jensen 1919) Schleifer and Kilpper-Balz 1984
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1352 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique	Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Enterococcaceae (family) › Enterococcus (genus)
Références taxonomiques PubMed	PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎

INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

🔎 Preuve SQLite

Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut	Agent thermodurique de post-acidification et d'accumulation de tyramine • Post-acidification non contrôlée, pâte crayeuse ou cassante, saveur amère et accumulation de tyramine et de 2-phényléthylamine • Provolone [en:provolone], Queso Cotija [en:cotija-cheese], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fontina [en:fontina], Valtellina casera [it:valtellina-casera]
Métabolites d'altération & filiation taxonomique	Décarboxylation enzymatique de la L-tyrosine et de la L-phénylalanine par la tyrosine décarboxylase membranaire (Tdc) couplée à l'antiporteur TyrP
Substrats documentés & synonymes historiques	Détartrage et désinfection de la machine à traire, maîtrise de l'hygiène du lait cru et utilisation de levains compétitifs dépourvus du gène tdc • Thermorésistance à la thermisation et pasteurisation basse, halotolérance (6.5 % NaCl), large spectre de pH (4.5-9.6) et de T° (10-45 °C)
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1352 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Collections de souches de référence	DSM 20477, ATCC 19434, NCTC 7171, CIP 103014
Sécurité opérateur & références PubMed	PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎

INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

🔎 Preuve SQLite

Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires	Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (4 éch.) • Thermoduric post-acidification and tyramine accumulation agent ; Agent thermodurique de post-acidification et d'accumulation de tyramine • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées	Pâtes pressées non cuites et demi-cuites, pâtes molles et fromages méditerranéens • Fontina [en:fontina], Valtellina casera [it:valtellina-casera], Provolone [en:provolone], Queso Cotija / Cotija cheese [en:cotija-cheese], Caciocavallo [en:caciocavallo] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Enterococcaceae (family) › Enterococcus (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA)	Fontina (EST 62.1 %, MNA 55.01 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Valtellina casera (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Provolone (EST 59.0 %, MNA 55.86 %, NaCl 1.85 g/100g) ; Queso Cotija (EST 62.0 %, MNA 54.29 %, NaCl 3.56 g/100g) • Enterococcus faecium (Orla-Jensen 1919) Schleifer and Kilpper-Balz 1984 • Streptococcus faecium
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:1352 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed	PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :

ALTERATION_TECHNOLOGIQUE_CUVE🔎 Preuve

Post-acidification non contrôlée, pâte crayeuse ou cassante, saveur amère et accumulation de tyramine et de 2-phényléthylamine

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste

Synonymes & Basionymes NCBI	Streptococcus faecium

🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (48) :

Palier 5 • Expert Absolu

Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB	PDB #1B7B (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq	RefSeq: GCA_009734005.2 • Taille: 2.9192 Mb • GC: 37.8567 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMEA3935374 • BioProject: PRJEB13267
Littérature primaire PubMed / DOI	PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎

📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :