Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #219574 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #219574
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Pseudomonas proteolytica
⚡ 4 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 4 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Pseudomonadales (order)
› Pseudomonadaceae (family)
› Pseudomonas (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (4) :
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:kefir ; en:pecorino ; it:pecorino-toscano — 10 échantillons)
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™
Palier 1
Index maître des ferments fromagers et affineurs
🔎 Preuve SQLite
| Matrices fromagères & substrats associés | Caciocavallo [en:caciocavallo], Pecorino toscano [it:pecorino-toscano], Kéfir [en:kefir], Pecorino [en:pecorino] • Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:kefir ; en:pecorino ; it:pecorino-toscano — 10 échantillons) |
|---|---|
| Typologie de pâte & preuves technologiques | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Bacteria • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:219574 • SegataLab/cFMD (Cell 2024) (10 échantillons fromagers positifs) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Bactériophages prédateurs & littérature PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Origines et habitacles écologiques
🔎 Preuve SQLite
| Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement | Pecorino toscano [it:pecorino-toscano], Kéfir / Kefir [en:kefir], Pecorino [en:pecorino], Caciocavallo [en:caciocavallo] • Italie ; Italie — Latium — Sardaigne ; Italie — Sicile • Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:kefir ; en:pecorino ; it:pecorino-toscano — 10 échantillons) |
|---|---|
| Souches déposées & collections de référence | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) |
| EST %, G/S % des matrices colonisées | Pecorino toscano (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Kéfir (EST 10.3 %, G/S 9.9 %) ; Pecorino (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:219574 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Substrat d'isolement documenté (NCBI Host) | Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:kefir ; en:pecorino ; it:pecorino-toscano — 10 échantillons) |
| Écologie & références PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Familles de fromages et technologies
🔎 Preuve SQLite
| Famille technologique & appellations associées | Fromages italiens ; Pecorino ; Boissons lactées fermentées ; Fromages de brebis ; Fromages à pâte filée • Pecorino toscano [it:pecorino-toscano], Kéfir / Kefir [en:kefir], Pecorino [en:pecorino], Caciocavallo [en:caciocavallo] • Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:kefir ; en:pecorino ; it:pecorino-toscano — 10 échantillons) |
|---|---|
| Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Fromageries documentées, substrats & collections | Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:kefir ; en:pecorino ; it:pecorino-toscano — 10 échantillons) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:219574 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices | Pecorino toscano (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Kéfir (EST 10.3 %, G/S 9.9 %) ; Pecorino (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed | Pecorino toscano (Appellation d'origine protégée) • DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Cheese metagenome (en:caciocavallo ; en:kefir ; en:pecorino ; it:pecorino-toscano — 10 échantillons) • Pecorino toscano [it:pecorino-toscano], Kéfir / Kefir [en:kefir], Pecorino [en:pecorino], Caciocavallo [en:caciocavallo] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Pecorino toscano (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Kéfir (EST 10.3 %, MNA 90.62 %, NaCl 0.1 g/100g) ; Pecorino (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:219574 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_024123875.1 • Taille: 6.33922 Mb • GC: 60.2 % • Statut: Complete Genome |
|---|---|
| Littérature primaire PubMed / DOI | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :