Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #2487355 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #2487355
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Pseudomonas carnis
⚡ 4 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 5 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Pseudomonadales (order)
› Pseudomonadaceae (family)
› Pseudomonas (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (5) :
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Cheese metagenome (en:asiago ; en:caciocavallo ; en:cheeses ; en:fresh-cheeses ; en:pecorino ; it:m — 16 échantillons)
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™
Palier 1
Index maître des ferments fromagers et affineurs
🔎 Preuve SQLite
| Matrices fromagères & substrats associés | Asiago [en:asiago], Monte veronese [it:monte-veronese], Pecorino [en:pecorino], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche [en:fresh-cheeses] • Cheese metagenome (en:asiago ; en:caciocavallo ; en:cheeses ; en:fresh-cheeses ; en:pecorino ; it:m — 16 échantillons) |
|---|---|
| Typologie de pâte & preuves technologiques | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Bacteria • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:2487355 • SegataLab/cFMD (Cell 2024) (16 échantillons fromagers positifs) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Bactériophages prédateurs & littérature PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Origines et habitacles écologiques
🔎 Preuve SQLite
| Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement | Asiago [en:asiago], Monte veronese [it:monte-veronese], Pecorino [en:pecorino], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • Italie ; Italie — Vénétie ; Italie — Latium — Sardaigne ; Italie — Sicile • Cheese metagenome (en:asiago ; en:caciocavallo ; en:cheeses ; en:fresh-cheeses ; en:pecorino ; it:m — 16 échantillons) |
|---|---|
| Souches déposées & collections de référence | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) |
| EST %, G/S % des matrices colonisées | Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Monte veronese (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Pecorino (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:2487355 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Substrat d'isolement documenté (NCBI Host) | Cheese metagenome (en:asiago ; en:caciocavallo ; en:cheeses ; en:fresh-cheeses ; en:pecorino ; it:m — 16 échantillons) |
| Écologie & références PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Familles de fromages et technologies
🔎 Preuve SQLite
| Famille technologique & appellations associées | Fromages italiens ; Fromages de brebis ; Fromages à pâte filée • Asiago [en:asiago], Monte veronese [it:monte-veronese], Pecorino [en:pecorino], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • Cheese metagenome (en:asiago ; en:caciocavallo ; en:cheeses ; en:fresh-cheeses ; en:pecorino ; it:m — 16 échantillons) |
|---|---|
| Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Fromageries documentées, substrats & collections | Cheese metagenome (en:asiago ; en:caciocavallo ; en:cheeses ; en:fresh-cheeses ; en:pecorino ; it:m — 16 échantillons) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:2487355 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices | Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Monte veronese (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Pecorino (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed | Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Monte veronese (Appellation d'origine protégée) • DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Cheese metagenome (en:asiago ; en:caciocavallo ; en:cheeses ; en:fresh-cheeses ; en:pecorino ; it:m — 16 échantillons) • Asiago [en:asiago], Monte veronese [it:monte-veronese], Pecorino [en:pecorino], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Asiago (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Monte veronese (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Pecorino (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:2487355 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_024722005.1 • Taille: 6.00969 Mb • GC: 60.1 % • Statut: Scaffold |
|---|---|
| Littérature primaire PubMed / DOI | DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:caciocavallo (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:fresh-cheeses (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:asiago (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:monte-veronese (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:pecorino (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheeses (n=2)