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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #294 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #294

Pseudomonas fluorescens "Bacillus fluorescens liquefaciens" Flugge 1886

🌍 Blue discoloration and fluorescent pigment defect agent ; Agent du défaut de coloration bleue/fluorescente des pâtes fraîches et filées

⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 4 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier

Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus)

🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (4) :

Palier 3 • Praticien & Affineur

Pâtes filées (Mozzarella, Burrata), fromages frais, pâtes molles humides, Queso Fresco

INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

🔎 Preuve SQLite

Concordance de nomenclature (NCBI)	Pseudomonas fluorescens ⟷ Bacillus fluorescens liquefaciens • Bacillus fluorescens • Bacterium fluorescen • Liquidomonas fluorescens
Synonymes & basionymes historiques	Blue discoloration and fluorescent pigment defect agent ; Agent du défaut de coloration bleue/fluorescente des pâtes fraîches et filées • Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence	"Bacillus fluorescens liquefaciens" Flugge 1886
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:294 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique	Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus)
Références taxonomiques PubMed	PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎

INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

🔎 Preuve SQLite

Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut	Agent du défaut de coloration bleue/fluorescente des pâtes fraîches et filées • Taches et marbrures bleu roi, bleu-vert ou jaune-vert fluorescent à la surface du fromage et dans le liquide de couverture, glaire et amertume • Fiore sardo [it:fiore-sardo], Lactosérum [en:whey], Mozzarella [en:mozzarella], Pecorino [en:pecorino]
Métabolites d'altération & filiation taxonomique	Biosynthèse de pigments sidérophores hydrosolubles (pyoverdine fluorescente) et d'indigoidine (pigment bipyridyle bleu insoluble) sous stress oxydatif
Substrats documentés & synonymes historiques	Traitement UV, filtration stérilisante ou chloration/pasteurisation des eaux de filage et des liquides de couverture, maintien d'un pH < 5.2 • Psychrotrophie marquée (croissance dès 2-4 °C), pH > 5.4, eau de refroidissement ou liquide de gouverne contaminé, présence d'oxygène
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:294 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Collections de souches de référence	DSM 50090, ATCC 13525, NCTC 10038, CIP 69.13
Sécurité opérateur & références PubMed	PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎

INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

🔎 Preuve SQLite

Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires	Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) • Blue discoloration and fluorescent pigment defect agent ; Agent du défaut de coloration bleue/fluorescente des pâtes fraîches et filées • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées	Pâtes filées (Mozzarella, Burrata), fromages frais, pâtes molles humides, Queso Fresco • Mozzarella [en:mozzarella], Fiore sardo [it:fiore-sardo], Pecorino [en:pecorino], Lactosérum / Whey [en:whey] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA)	Mozzarella (EST 50.0 %, MNA 64.18 %, NaCl 1.23 g/100g) ; Fiore sardo (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Pecorino (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Lactosérum (EST 96.49 %, MNA 3.53 %, NaCl 2.46 g/100g) • "Bacillus fluorescens liquefaciens" Flugge 1886 • Bacillus fluorescens liquefaciens • Bacillus fluorescens • Bacterium fluorescen • Liquidomonas fluorescens
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:294 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed	PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :

DEFAUT_PIGMENTAIRE_TACHES🔎 Preuve

Taches et marbrures bleu roi, bleu-vert ou jaune-vert fluorescent à la surface du fromage et dans le liquide de couverture, glaire et amertume

DEFAUT_PIGMENTAIRE_TACHES🔎 Preuve

Taches et marbrures bleu roi, bleu-vert ou jaune-vert fluorescent à la surface du fromage et dans le liquide de couverture, glaire et amertume

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste

Synonymes & Basionymes NCBI	Bacillus fluorescens liquefaciens • Bacillus fluorescens • Bacterium fluorescen • Liquidomonas fluorescens

🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (16) :

Palier 5 • Expert Absolu

Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB	PDB #1A8S (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq	RefSeq: GCA_900475215.1 • Taille: 6.51517 Mb • GC: 60 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN15435700 • BioProject: PRJNA640378
Littérature primaire PubMed / DOI	PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎

📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :