Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #303 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #303
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Pseudomonas putida Arthrobacter siderocapsulatus Dubinina and Zhdanov 1975 (Approved Lists 1980)
🌍 Psychrotrophic fluorescent/brown discoloration and surface slime agent ; Agent psychrotrophe de coloration fluorescente/brune et de glaire corticale
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 2 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Pseudomonadales (order)
› Pseudomonadaceae (family)
› Pseudomonas (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (2) :
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes filées (Mozzarella, Burrata), fromages frais, pâtes molles à croûte lavée ou fleurie
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Pseudomonas putida ⟷ Arthrobacter siderocapsulatus • Bacillus fluorescens putidus • Bacillus putidus • Pseudomonas arvilla • Pseudomonas convexa • Pseudomonas eisenbergii • Pseudomonas incognita • Pseudomonas ovalis • Pseudomonas rugosa • Pseudomonas striata |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Psychrotrophic fluorescent/brown discoloration and surface slime agent ; Agent psychrotrophe de coloration fluorescente/brune et de glaire corticale • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Arthrobacter siderocapsulatus Dubinina and Zhdanov 1975 (Approved Lists 1980) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:303 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent psychrotrophe de coloration fluorescente/brune et de glaire corticale • Glaire superficielle jaunâtre à brunâtre ou reflets jaune-vert fluorescents, odeur putride-soufrée et ramollissement cortical • Lactosérum [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo] |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Synthèse de sidérophores pyoverdines fluorescentes, oxydation de composés phénoliques/tyrosine et sécrétion de métalloprotéases AprX |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Traitement de l'eau de process (filtration, UV), maîtrise de la chaîne du froid, acidification rapide et bioprotection lactique • Psychrotrophie (croissance dès 4 °C), contamination par l'eau de filage ou de lavage, pH > 5.4, aérobiose |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:303 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 291, ATCC 12633, NCTC 10936, CIP 52.191 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (4 éch.) • Psychrotrophic fluorescent/brown discoloration and surface slime agent ; Agent psychrotrophe de coloration fluorescente/brune et de glaire corticale • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Pâtes filées (Mozzarella, Burrata), fromages frais, pâtes molles à croûte lavée ou fleurie • Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Pseudomonadales (order) › Pseudomonadaceae (family) › Pseudomonas (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Lactosérum (EST 96.49 %, MNA 3.53 %, NaCl 2.46 g/100g) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) • Arthrobacter siderocapsulatus Dubinina and Zhdanov 1975 (Approved Lists 1980) • Arthrobacter siderocapsulatus • Bacillus fluorescens putidus • Bacillus putidus • Pseudomonas arvilla • Pseudomonas convexa • Pseudomonas eisenbergii • Pseudomonas incognita • Pseudomonas ovalis • Pseudomonas rugosa • Pseudomonas striata |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:303 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎 |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (2)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent psychrotrophe de coloration fluorescente
DEFAUT_PIGMENTAIRE_TACHES🔎 Preuve
Glaire superficielle jaunâtre à brunâtre ou reflets jaune-vert fluorescents, odeur putride-soufrée et ramollissement cortical
⚠️ Brune et de glaire corticale
DEFAUT_PIGMENTAIRE_TACHES🔎 Preuve
Glaire superficielle jaunâtre à brunâtre ou reflets jaune-vert fluorescents, odeur putride-soufrée et ramollissement cortical
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Arthrobacter siderocapsulatus • Bacillus fluorescens putidus • Bacillus putidus • Pseudomonas arvilla • Pseudomonas convexa • Pseudomonas eisenbergii • Pseudomonas incognita • Pseudomonas ovalis • Pseudomonas rugosa • Pseudomonas striata |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (28) :
🦠 Pseudomonas putida B001
#1048261
🦠 Pseudomonas putida B6-2
#1081940
🦠 Pseudomonas putida BIRD-1
#931281
🦠 Pseudomonas putida DOT-T1E
#1196325
🦠 Pseudomonas putida GB-1
#76869
🦠 Pseudomonas putida H8234
#1331671
🦠 Pseudomonas putida HB3267
#1215088
🦠 Pseudomonas putida JB
#1150601
🦠 Pseudomonas putida JCM 18452
#1295132
🦠 Pseudomonas putida JCM 9802
#1295131
🦠 Pseudomonas putida KG-4
#1410521
🦠 Pseudomonas putida KT2440
#160488
🦠 Pseudomonas putida LF54
#1299319
🦠 Pseudomonas putida LS46
#1193146
🦠 Pseudomonas putida MR3
#1312921
🦠 Pseudomonas putida NBRC 14164
#1211579
🦠 Pseudomonas putida ND6
#231023
🦠 Pseudomonas putida OUS82
#1410669
🦠 Pseudomonas putida S11
#1218169
🦠 Pseudomonas putida S12
#1215087
🦠 Pseudomonas putida S13.1.2
#1384061
🦠 Pseudomonas putida S16
#1042876
🦠 Pseudomonas putida S610
#1399145
🦠 Pseudomonas putida SJ3
#1388760
🦠 Pseudomonas putida SJTE-1
#1193499
🦠 Pseudomonas putida TRO1
#1227924
🦠 Pseudomonas putida W15Oct28
#1449986
🦠 Pseudomonas putida str. Idaho
#1079364
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #10ED (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_000412675.1 • Taille: 6.1567 Mb • GC: 62.3 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN29159029 • BioProject: PRJNA850115 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:21854908 🔎 • DOI:10.3168/jds.2011-4313 🔎 |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :