STANDARD V14.4 • ROUTAGE O(1) Architecture relationnelle 24 pôles & 17 Index-Experts™ synchronisés avec la taxonomie NCBI 2026, EBI SIFTS 3D et cFMD/FMBN.
TYRODEXIA™ & NCBI 2026
Grand dictionnaire du microbiome des fromages
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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #33962 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #33962
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Lentilactobacillus kefiri

⚡ 4 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1))  •  🧀 5 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)  •  🧊 12 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lentilactobacillus (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (5) :
🧀 Blue cheese 🧀 Castelmagno 🧀 Cheese core 🧀 Kéfir 🧀 Saint-Marcellin

🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)

Palier 3 • Praticien & Affineur
Cheese metagenome (en:cheeses ; en:kefir ; en:saint-marcellin ; it:castelmagno — 104 échantillons)
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™ Palier 1

Index maître des ferments fromagers et affineurs

🔎 Preuve SQLite
Matrices fromagères & substrats associés Castelmagno [it:castelmagno], Kéfir [en:kefir], Blue cheese [en:blue-cheese], Saint-Marcellin [en:saint-marcellin], Cheese core [en:cheese-core] • Cheese metagenome (en:cheeses ; en:kefir ; en:saint-marcellin ; it:castelmagno — 104 échantillons)
Typologie de pâte & preuves technologiques Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (72 éch.) • Bacteria • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lentilactobacillus (genus)
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:33962 • SegataLab/cFMD (Cell 2024) (104 échantillons fromagers positifs) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Bactériophages prédateurs & littérature PubMed DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™ Palier 2

Origines et habitacles écologiques

🔎 Preuve SQLite
Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement Castelmagno [it:castelmagno], Saint-Marcellin [en:saint-marcellin], Kéfir / Kefir [en:kefir], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core] • Italie ; France — Isère • Cheese metagenome (en:cheeses ; en:kefir ; en:saint-marcellin ; it:castelmagno — 104 échantillons)
Souches déposées & collections de référence Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (72 éch.)
EST %, G/S % des matrices colonisées Castelmagno (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Saint-Marcellin (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Kéfir (EST 10.3 %, G/S 9.9 %) ; Blue cheese (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) • Bacteria
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:33962 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Substrat d'isolement documenté (NCBI Host) Cheese metagenome (en:cheeses ; en:kefir ; en:saint-marcellin ; it:castelmagno — 104 échantillons)
Écologie & références PubMed DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™ Palier 1

Familles de fromages et technologies

🔎 Preuve SQLite
Famille technologique & appellations associées Fromages italiens ; Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte molle à croûte fleurie ; Boissons lactées fermentées • Castelmagno [it:castelmagno], Saint-Marcellin [en:saint-marcellin], Kéfir / Kefir [en:kefir], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core] • Cheese metagenome (en:cheeses ; en:kefir ; en:saint-marcellin ; it:castelmagno — 104 échantillons)
Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (72 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lentilactobacillus (genus)
Fromageries documentées, substrats & collections Cheese metagenome (en:cheeses ; en:kefir ; en:saint-marcellin ; it:castelmagno — 104 échantillons)
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:33962 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices Castelmagno (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Saint-Marcellin (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Kéfir (EST 10.3 %, G/S 9.9 %) ; Blue cheese (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) • Bacteria
Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed Castelmagno (Appellation d'origine protégée • denominazione di origine protetta • Indicazione geografica protetta) ; Saint-Marcellin (indication géographique protégée) • DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite
Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (72 éch.) • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées Cheese metagenome (en:cheeses ; en:kefir ; en:saint-marcellin ; it:castelmagno — 104 échantillons) • Castelmagno [it:castelmagno], Saint-Marcellin [en:saint-marcellin], Kéfir / Kefir [en:kefir], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lentilactobacillus (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) Castelmagno (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Saint-Marcellin (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Kéfir (EST 10.3 %, MNA 90.62 %, NaCl 0.1 g/100g) ; Blue cheese (EST 57.6 %, MNA 59.47 %, NaCl 2.92 g/100g)
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:33962 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu
Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB PDB #4RF2 (12 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq RefSeq: GCA_009739535.1 • Taille: 2.48903 Mb • GC: 41.8837 % • Statut: Complete Genome
Littérature primaire PubMed / DOI DOI:10.1016/j.cell.2024.07.039 🔎 (cFMD) • FoodMicrobionet
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:kefir (n=72) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:cheeses (n=24) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : it:castelmagno (n=2) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:blue-cheese (n=2) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:saint-marcellin (n=2) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:cheese-core (n=2)