Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #565642 • STRAIN • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #565642
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Enterococcus faecalis ATCC 4200 Enterococcus faecalis (Andrewes and Horder 1906) Schleifer and Kilpper-Balz 1984
🌍 Thermoduric acidification drift and tyramine accumulation agent ; Agent de dérive d'acidification thermodurique et d'accumulation de tyramine
⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 7 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 1 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Lactobacillales (order)
› Enterococcaceae (family)
› Enterococcus (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (7) :
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Pâtes pressées non cuites et demi-cuites, pâtes molles, fromages méditerranéens
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Enterococcus faecalis ATCC 4200 ⟷ Enterococcus faecalis strain ATCC 4200 • Enterococcus faecalis str. ATCC 4200 |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Thermoduric acidification drift and tyramine accumulation agent ; Agent de dérive d'acidification thermodurique et d'accumulation de tyramine • Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Enterococcus faecalis (Andrewes and Horder 1906) Schleifer and Kilpper-Balz 1984 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:565642 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Enterococcaceae (family) › Enterococcus (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent de dérive d'acidification thermodurique et d'accumulation de tyramine • Acidification secondaire non maîtrisée, texture cassante ou pâteuse, amertume et accumulation d'amines biogènes vasoactives (tyramine) • Pecorino [en:pecorino], Provolone [en:provolone], Fontina [en:fontina], Blue cheese [en:blue-cheese], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche [en:fresh-cheeses] |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Protéolyse secondaire non spécifique et décarboxylation enzymatique de la L-tyrosine par la tyrosine décarboxylase (TdcA) en tyramine |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Hygiène de la machine à traire (élimination du tartre lactique), sélection de souches d'affinage Tdc-négatives, maîtrise de la pasteurisation • Survie à la thermisation/pasteurisation basse, tolérance élevée au sel (jusqu'à 6.5 % NaCl) et au pH (4.5-9.6), T° 10-45 °C |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:565642 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 20478, ATCC 19433, NCTC 775, CIP 103015 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Flore de vigilance métagénomique (8 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (6 éch.) • Thermoduric acidification drift and tyramine accumulation agent ; Agent de dérive d'acidification thermodurique et d'accumulation de tyramine • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Pâtes pressées non cuites et demi-cuites, pâtes molles, fromages méditerranéens • Fontina [en:fontina], Rocamadour [en:rocamadour], Pecorino [en:pecorino], Provolone [en:provolone], Blue cheese [en:blue-cheese], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Enterococcaceae (family) › Enterococcus (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Fontina (EST 62.1 %, MNA 55.01 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Rocamadour (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Pecorino (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Provolone (EST 59.0 %, MNA 55.86 %, NaCl 1.85 g/100g) • Enterococcus faecalis (Andrewes and Horder 1906) Schleifer and Kilpper-Balz 1984 • Enterococcus faecalis strain ATCC 4200 • Enterococcus faecalis str. ATCC 4200 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:565642 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎 |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Enterococcus faecalis strain ATCC 4200 • Enterococcus faecalis str. ATCC 4200 |
|---|
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #3S5U (1 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_000157195.1 • Taille: 3.03617 Mb • GC: 37.5 % • Statut: Scaffold • BioSample: SAMN02595252 • BioProject: PRJNA32923 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2009.10.002 🔎 |