Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #569 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #569
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Hafnia alvei "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963
⚡ 9 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 9 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 8 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Hafniaceae (family)
› Hafnia (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (9) :
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™
Palier 1
Index maître des ferments fromagers et affineurs
🔎 Preuve SQLite
| Matrices fromagères & substrats associés | Camemberts [en:camemberts], Lactosérum [en:whey], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche [en:fresh-cheeses], Rocamadour [en:rocamadour], Livarot [en:livarot], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher] |
|---|---|
| Typologie de pâte & preuves technologiques | Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) • Bacteria • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Métabolites secondaires & collections de référence | GCA_011617105.1 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:569 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| EST %, G/S % des matrices fromagères | Taille: 4.77205 Mb • GC: 48.7715 % • "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963 |
| Bactériophages prédateurs & littérature PubMed | Phages: Hafnia phage vB_HalM_SPARTY • PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
🔎 Preuve SQLite
| Concordance de nomenclature (NCBI) | Hafnia alvei ⟷ Enterobacter aerogenes subsp. hafniae • Enterobacter alvei • Enterobacter hafniae • Hafnia alvei sensu stricto genomosp. 1 |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:569 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Origines et habitacles écologiques
🔎 Preuve SQLite
| Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement | Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • France — Calvados — Eure ; France — Lot ; France — Loir-et-Cher ; France — Indre-et-Loire — Vienne ; Portugal — Castelo Branco |
|---|---|
| Souches déposées & collections de référence | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) |
| EST %, G/S % des matrices colonisées | Livarot (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Rocamadour (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) • Bacteria |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:569 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Écologie & références PubMed | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Familles de fromages et technologies
🔎 Preuve SQLite
| Famille technologique & appellations associées | Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte molle à croûte lavée ; Fromages de chèvre ; Fromages à pâte molle à croûte naturelle • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] |
|---|---|
| Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:569 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices | Livarot (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Rocamadour (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) • Bacteria |
| Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed | Livarot (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Rocamadour (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Selles-sur-Cher (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Sainte-Maure de Touraine (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #05 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Marqueurs technologiques (pH et gaz)
🔎 Preuve SQLite
| Substrats glucidiques, lactose résiduel (USDA) & métabolites | Total lipid (fat) : 10.8 g ; Carbohydrate, by difference : 25 g ; Énergie : 229 kcal ; Eau : 54.7 g • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey] |
|---|---|
| Rôle métabolique & composés caractérisés | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Égouttage, humidité, salage (USDA) & matrices reliées | Livarot (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Rocamadour (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey] |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:569 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Surveillance phagique en cuve & références PubMed | Phages: Hafnia phage vB_HalM_SPARTY (TaxID:2894718) • PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Livarot (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Rocamadour (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) • "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963 • Enterobacter aerogenes subsp. hafniae • Enterobacter alvei • Enterobacter hafniae • Hafnia alvei sensu stricto genomosp. 1 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:569 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #10 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Terroirs et appellations protégées
🔎 Preuve SQLite
| Fromages reliés & bassins laitiers d'origine | Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • France — Calvados — Eure ; France — Lot ; France — Loir-et-Cher ; France — Indre-et-Loire — Vienne ; Portugal — Castelo Branco |
|---|---|
| Appellations officielles (AOP/DOP/IGP) & croûtes | Livarot (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Rocamadour (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Selles-sur-Cher (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Sainte-Maure de Touraine (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Fromageries de terroir & palmarès officiels | "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:569 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Collections de référence, BioSample & BioProject | SAMEA114444132 • PRJEB65351 |
| Audit de terroir & références PubMed | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #11 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Volatilome et profils aromatiques
🔎 Preuve SQLite
| Composés aromatiques ponts (FlavorGraph) & volatils | trimethylamine ; salicylic acid ; propionic acid ; phenylacetaldehyde ; phenol ; oleic acid ; octanoic acid ; methanethiol • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey] |
|---|---|
| Précurseurs lipidiques & aminés d'arômes (USDA) | Cholestérol : 116 mg ; Fatty acids, total monounsaturated : 4.52 g ; MUFA 18:1 : 4.41 g ; Fatty acids, total saturated : 2.72 g ; Glutamic acid : 1.72 g ; Leucine : 0.621 g ; Proline : 0.588 g • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Accords gastronomiques & affinités sensorielles | Brioche Bread ; Cointreau Liqueur ; Chicken Liver ; Gin ; Star Anise |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:569 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Cinétique aromatique & études PubMed | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #14 • Science du lait & santé Tyrodexia™
Palier 4
Peptidome bioactif, santé fonctionnelle et vigilance clinique
🔎 Preuve SQLite
| Vitamines cardioprotectrices (USDA) & bioactifs | Folate, DFE : 57 µg ; Vitamin A, IU : 503 IU ; Retinol : 118 µg ; Vitamin A, RAE : 124 µg ; Carotene, beta : 66 µg ; Folic acid : 20 µg |
|---|---|
| Acides aminés fonctionnels (GABA, Proline USDA) | Glutamic acid : 1.72 g ; Leucine : 0.621 g ; Proline : 0.588 g ; Aspartic acid : 0.578 g ; Serine : 0.465 g ; Valine : 0.419 g • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus) |
| Acides gras bioactifs (ALC, Oméga-3) & minéraux | Cholestérol : 116 mg ; Fatty acids, total monounsaturated : 4.52 g ; MUFA 18:1 : 4.41 g ; Fatty acids, total saturated : 2.72 g ; Calcium, Ca : 100 mg ; Potassium, K : 134 mg ; Zinc, Zn : 0.67 mg ; Iron, Fe : 1.67 mg • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey] |
| Extinction réelle du lactose & sucres (USDA) | Eau : 54.7 g ; Protein : 7.7 g ; Ash : 1.8 g |
| Collections de référence, autorité & synonymes | "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963 • Enterobacter aerogenes subsp. hafniae • Enterobacter alvei • Enterobacter hafniae • Hafnia alvei sensu stricto genomosp. 1 |
| Littérature scientifique PubMed | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:569 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (2)
Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :
⚠️ Agent de surproduction soufrée
ALTERATION_GUSTATIVE_AROME🔎 Preuve
Notes aromatiques soufrées excessives (ail, chou bouilli, caoutchouc brûlé), petits trous secondaires sous croûte et pâte ramollie
⚠️ Alliacée et d'ouverture secondaire
ALTERATION_GUSTATIVE_AROME🔎 Preuve
Notes aromatiques soufrées excessives (ail, chou bouilli, caoutchouc brûlé), petits trous secondaires sous croûte et pâte ramollie
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| Synonymes & Basionymes NCBI | Enterobacter aerogenes subsp. hafniae • Enterobacter alvei • Enterobacter hafniae • Hafnia alvei sensu stricto genomosp. 1 |
|---|
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (3) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #4ARO (8 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_011617105.1 • Taille: 4.77205 Mb • GC: 48.7715 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMEA114444132 • BioProject: PRJEB65351 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎 |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheeses (n=48)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:whey (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:sainte-maure-de-touraine (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:blue-cheese (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:fresh-cheeses (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:rocamadour (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:livarot (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:camemberts (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:selles-sur-cher (n=2)