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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #630 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #630

Yersinia enterocolitica "Bacterium enterocoliticum" Schleifstein and Coleman 1939

🌍 Psychrotrophic enteric yersiniosis foodborne pathogen ; Agent pathogène psychrotrophe de la yersiniose entérique

⚡ 3 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier

Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Yersiniaceae (family) › Yersinia (genus)

Palier 3 • Praticien & Affineur

Fromages frais, pâtes molles au lait cru ou recontaminées post-pasteurisation, laits de fromagerie

INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

🔎 Preuve SQLite

Concordance de nomenclature (NCBI)	Yersinia enterocolitica ⟷ Bacterium enterocoliticum
Synonymes & basionymes historiques	Psychrotrophic enteric yersiniosis foodborne pathogen ; Agent pathogène psychrotrophe de la yersiniose entérique • Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence	"Bacterium enterocoliticum" Schleifstein and Coleman 1939
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:630 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique	Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Yersiniaceae (family) › Yersinia (genus)
Références taxonomiques PubMed	PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎

INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

🔎 Preuve SQLite

Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut	Agent pathogène psychrotrophe de la yersiniose entérique • Aucune altération visuelle ou olfactive détectable du fromage ; gastro-entérite aiguë fébrile et adénite mésentérique (sérotypes pathogènes porteurs du plasmide pYV)
Métabolites d'altération & filiation taxonomique	Expression de l'uréase (neutralisation de l'acidité locale) et synthèse de l'entérotoxine thermostable Yst et des facteurs d'invasion Ail/YadA
Substrats documentés & synonymes historiques	Hygiène stricte de la traite et de l'eau en ferme, pasteurisation maîtrisée, acidification lactique rapide en cuve (< pH 5.0) et prévention des recontaminations • Psychrotrophie prononcée (multiplication active de 0 à 4 °C), ralentissement de l'acidification lactique (pH > 5.2), tolérance jusqu'à 5 % NaCl
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:630 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Collections de souches de référence	DSM 4780, ATCC 9610, NCTC 10460, CIP 80.27
Sécurité opérateur & références PubMed	PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎

INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

🔎 Preuve SQLite

Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires	Psychrotrophic enteric yersiniosis foodborne pathogen ; Agent pathogène psychrotrophe de la yersiniose entérique • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées	Fromages frais, pâtes molles au lait cru ou recontaminées post-pasteurisation, laits de fromagerie • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Yersiniaceae (family) › Yersinia (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA)	"Bacterium enterocoliticum" Schleifstein and Coleman 1939 • Bacterium enterocoliticum
Sources officielles & ouvrage de référence	TaxID:630 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed	PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :

PATHOGENE_REGLEMENTAIRE_STRICT🔎 Preuve

Aucune altération visuelle ou olfactive détectable du fromage ; gastro-entérite aiguë fébrile et adénite mésentérique (sérotypes pathogènes porteur…

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste

Synonymes & Basionymes NCBI	Bacterium enterocoliticum

🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (15) :

Palier 5 • Expert Absolu

Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB	PDB #1LYV (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq	RefSeq: GCA_000253175.1 • Taille: 4.62588 Mb • GC: 46.953 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMEA980149 • BioProject: PRJEB2116
Littérature primaire PubMed / DOI	PMID:25636912 🔎 • DOI:10.3168/jds.2014-8796 🔎