STANDARD V14.4 • ROUTAGE O(1) Architecture relationnelle 24 pôles & 17 Index-Experts™ synchronisés avec la taxonomie NCBI 2026, EBI SIFTS 3D et cFMD/FMBN.
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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #69966 • SPECIES • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #69966
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Macrococcoides caseolyticum Macrococcus caseolyticus (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Kloos et al. 1998

⚡ 8 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1))  •  🧀 5 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)  •  🧊 1 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Macrococcoides (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (5) :
🧀 Caciocavallo 🧀 Comté 🧀 Fromages à pâte fraîche 🧀 Lactosérum 🧀 Livarot
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™ Palier 1

Index maître des ferments fromagers et affineurs

🔎 Preuve SQLite
Matrices fromagères & substrats associés Comté [en:comte], Lactosérum [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche [en:fresh-cheeses], Livarot [en:livarot]
Typologie de pâte & preuves technologiques Coque caséinolytique du lait cru libérant rapidement de courts peptides hydrophiles et des précurseurs aromatiques soufrés et beurrés ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (6 éch.) • Bacteria • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Macrococcoides (genus)
Métabolites secondaires & collections de référence GCA_016028795.1
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:69966 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
EST %, G/S % des matrices fromagères Taille: 2.17097 Mb • GC: 36.5992 % • Macrococcus caseolyticus (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Kloos et al. 1998
Bactériophages prédateurs & littérature PubMed PMID:9828436 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-3-859 🔎
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Synonymies et anciens noms (NCBI)

🔎 Preuve SQLite
Concordance de nomenclature (NCBI) Macrococcoides caseolyticum ⟷ Macrococcoides caseolyticum corrig. (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Bello et al. 2024 • Macrococcus caseolyticus • Staphylococcus caseilyticus • Staphylococcus caseolyticus (ex Evans 1916) Schleifer et al. 1982
Synonymes & basionymes historiques Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence Macrococcus caseolyticus (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Kloos et al. 1998
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:69966 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Macrococcoides (genus)
Références taxonomiques PubMed PMID:9828436 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-3-859 🔎
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™ Palier 2

Origines et habitacles écologiques

🔎 Preuve SQLite
Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement Livarot [en:livarot], Comté [en:comte], Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • France — Calvados — Eure ; Italie — Sicile
Souches déposées & collections de référence Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Coque caséinolytique du lait cru libérant rapidement de courts peptides hydrophiles et des précurseurs aromatiques soufrés et beurrés ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.)
EST %, G/S % des matrices colonisées Livarot (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Lactosérum (EST 96.49 %, G/S 0.56 %) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Fromages à pâte fraîche (EST 23.8 %, G/S 39.96 %) • Bacteria
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:69966 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Écologie & références PubMed PMID:9828436 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-3-859 🔎
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™ Palier 1

Familles de fromages et technologies

🔎 Preuve SQLite
Famille technologique & appellations associées Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte molle à croûte lavée ; Fromages italiens ; Fromages à pâte filée • Livarot [en:livarot], Comté [en:comte], Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses]
Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Coque caséinolytique du lait cru libérant rapidement de courts peptides hydrophiles et des précurseurs aromatiques soufrés et beurrés ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Macrococcoides (genus)
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:69966 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices Livarot (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Lactosérum (EST 96.49 %, G/S 0.56 %) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Fromages à pâte fraîche (EST 23.8 %, G/S 39.96 %) • Bacteria
Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed Livarot (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • PMID:9828436 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-3-859 🔎
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite
Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Coque caséinolytique du lait cru libérant rapidement de courts peptides hydrophiles et des précurseurs aromatiques soufrés et beurrés ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées Livarot [en:livarot], Comté [en:comte], Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Macrococcoides (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) Livarot (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Lactosérum (EST 96.49 %, MNA 3.53 %, NaCl 2.46 g/100g) ; Caciocavallo (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Fromages à pâte fraîche (EST 23.8 %, MNA 84.21 %, NaCl 0.36 g/100g) • Macrococcus caseolyticus (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Kloos et al. 1998 • Macrococcoides caseolyticum corrig. (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Bello et al. 2024 • Macrococcus caseolyticus • Staphylococcus caseilyticus • Staphylococcus caseolyticus (ex Evans 1916) Schleifer et al. 1982
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:69966 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed PMID:9828436 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-3-859 🔎
INDEX-EXPERT™ #10 • Architecture Tyrodexia™ Palier 1

Terroirs et appellations protégées

🔎 Preuve SQLite
Fromages reliés & bassins laitiers d'origine Livarot [en:livarot], Comté [en:comte], Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • France — Calvados — Eure ; Italie — Sicile
Appellations officielles (AOP/DOP/IGP) & croûtes Livarot (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Macrococcoides (genus)
Fromageries de terroir & palmarès officiels Macrococcus caseolyticus (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Kloos et al. 1998
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:69966 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Collections de référence, BioSample & BioProject SAMN29159834 • PRJNA850115
Audit de terroir & références PubMed PMID:9828436 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-3-859 🔎
INDEX-EXPERT™ #11 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Volatilome et profils aromatiques

🔎 Preuve SQLite
Composés aromatiques ponts (FlavorGraph) & volatils Livarot [en:livarot], Comté [en:comte], Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses]
Précurseurs lipidiques & aminés d'arômes (USDA) Cholestérol : 116 mg ; Fatty acids, total monounsaturated : 4.52 g ; MUFA 18:1 : 4.41 g ; Fatty acids, total saturated : 2.72 g ; Glutamic acid : 1.72 g ; Leucine : 0.621 g ; Proline : 0.588 g • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Coque caséinolytique du lait cru libérant rapidement de courts peptides hydrophiles et des précurseurs aromatiques soufrés et beurrés ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Macrococcoides (genus)
Accords gastronomiques & affinités sensorielles Brioche Bread ; Cointreau Liqueur ; Chicken Liver ; Gin ; Star Anise
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:69966 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Cinétique aromatique & études PubMed PMID:9828436 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-3-859 🔎
INDEX-EXPERT™ #14 • Science du lait & santé Tyrodexia™ Palier 4

Peptidome bioactif, santé fonctionnelle et vigilance clinique

🔎 Preuve SQLite
Vitamines cardioprotectrices (USDA) & bioactifs Folate, DFE : 57 µg ; Vitamin A, IU : 503 IU ; Retinol : 118 µg ; Vitamin A, RAE : 124 µg ; Carotene, beta : 66 µg ; Folic acid : 20 µg
Acides aminés fonctionnels (GABA, Proline USDA) Glutamic acid : 1.72 g ; Leucine : 0.621 g ; Proline : 0.588 g ; Aspartic acid : 0.578 g ; Serine : 0.465 g ; Valine : 0.419 g • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Macrococcoides (genus)
Acides gras bioactifs (ALC, Oméga-3) & minéraux Cholestérol : 116 mg ; Fatty acids, total monounsaturated : 4.52 g ; MUFA 18:1 : 4.41 g ; Fatty acids, total saturated : 2.72 g ; Calcium, Ca : 100 mg ; Potassium, K : 134 mg ; Zinc, Zn : 0.67 mg ; Iron, Fe : 1.67 mg • Livarot [en:livarot], Comté [en:comte], Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses]
Extinction réelle du lactose & sucres (USDA) Eau : 54.7 g ; Protein : 7.7 g ; Ash : 1.8 g
Collections de référence, autorité & synonymes Macrococcus caseolyticus (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Kloos et al. 1998 • Macrococcoides caseolyticum corrig. (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Bello et al. 2024 • Macrococcus caseolyticus • Staphylococcus caseilyticus • Staphylococcus caseolyticus (ex Evans 1916) Schleifer et al. 1982
Littérature scientifique PubMed PMID:9828436 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-3-859 🔎
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:69966 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)

⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :

⚠️ Agent coccoïde laitier d'hyper-protéolyse caséique, de ramollissement excessif et d'amertume
ALTERATION_TECHNOLOGIQUE_CUVE🔎 Preuve
Protéolyse précoce et non maîtrisée, pâte molle et collante manquant de tenue, amertume peptidique franche
Consulter la fiche clinique 360° →

🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste
Synonymes & Basionymes NCBI Macrococcoides caseolyticum corrig. (Schleifer et al. 1982 ex Evans 1916) Bello et al. 2024 • Macrococcus caseolyticus • Staphylococcus caseilyticus • Staphylococcus caseolyticus (ex Evans 1916) Schleifer et al. 1982
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (3) :
🦠 Macrococcoides caseolyticum JCSC5402 #458233 🦠 Macrococcoides caseolyticum subsp. caseolyticum #2233644 🦠 Macrococcoides caseolyticum subsp. hominis #1891096

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu
Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB PDB #8AIN (1 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq RefSeq: GCA_016028795.1 • Taille: 2.17097 Mb • GC: 36.5992 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN29159834 • BioProject: PRJNA850115
Littérature primaire PubMed / DOI PMID:9828436 🔎 • DOI:10.1099/00207713-48-3-859 🔎
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:cheeses (n=40) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:whey (n=8) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:caciocavallo (n=6) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:fresh-cheeses (n=2) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:livarot (n=2)